Protein–RNA interactions for Protein: Q96RK1

CITED4, Cbp/p300-interacting transactivator 4, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED4Q96RK1 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CITED4Q96RK1 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CITED4Q96RK1 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CITED4Q96RK1 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CITED4Q96RK1 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CITED4Q96RK1 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CITED4Q96RK1 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CITED4Q96RK1 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CITED4Q96RK1 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CITED4Q96RK1 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CITED4Q96RK1 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CITED4Q96RK1 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CITED4Q96RK1 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CITED4Q96RK1 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CITED4Q96RK1 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CITED4Q96RK1 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CITED4Q96RK1 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CITED4Q96RK1 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CITED4Q96RK1 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CITED4Q96RK1 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CITED4Q96RK1 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CITED4Q96RK1 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CITED4Q96RK1 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CITED4Q96RK1 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CITED4Q96RK1 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CITED4Q96RK1 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CITED4Q96RK1 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CITED4Q96RK1 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CITED4Q96RK1 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CITED4Q96RK1 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CITED4Q96RK1 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CITED4Q96RK1 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CITED4Q96RK1 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CITED4Q96RK1 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CITED4Q96RK1 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CITED4Q96RK1 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CITED4Q96RK1 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CITED4Q96RK1 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CITED4Q96RK1 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CITED4Q96RK1 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CITED4Q96RK1 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CITED4Q96RK1 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CITED4Q96RK1 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CITED4Q96RK1 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CITED4Q96RK1 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CITED4Q96RK1 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CITED4Q96RK1 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CITED4Q96RK1 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CITED4Q96RK1 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CITED4Q96RK1 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CITED4Q96RK1 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CITED4Q96RK1 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CITED4Q96RK1 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CITED4Q96RK1 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CITED4Q96RK1 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CITED4Q96RK1 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CITED4Q96RK1 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CITED4Q96RK1 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CITED4Q96RK1 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CITED4Q96RK1 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CITED4Q96RK1 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CITED4Q96RK1 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CITED4Q96RK1 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CITED4Q96RK1 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CITED4Q96RK1 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CITED4Q96RK1 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CITED4Q96RK1 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CITED4Q96RK1 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CITED4Q96RK1 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CITED4Q96RK1 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CITED4Q96RK1 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CITED4Q96RK1 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CITED4Q96RK1 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CITED4Q96RK1 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CITED4Q96RK1 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CITED4Q96RK1 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CITED4Q96RK1 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CITED4Q96RK1 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CITED4Q96RK1 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CITED4Q96RK1 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CITED4Q96RK1 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CITED4Q96RK1 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CITED4Q96RK1 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CITED4Q96RK1 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CITED4Q96RK1 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CITED4Q96RK1 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CITED4Q96RK1 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CITED4Q96RK1 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CITED4Q96RK1 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CITED4Q96RK1 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CITED4Q96RK1 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CITED4Q96RK1 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CITED4Q96RK1 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CITED4Q96RK1 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CITED4Q96RK1 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CITED4Q96RK1 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CITED4Q96RK1 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CITED4Q96RK1 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CITED4Q96RK1 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CITED4Q96RK1 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms