Protein–RNA interactions for Protein: Q96P20

NLRP3, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP3Q96P20 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NLRP3Q96P20 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NLRP3Q96P20 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NLRP3Q96P20 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NLRP3Q96P20 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NLRP3Q96P20 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NLRP3Q96P20 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NLRP3Q96P20 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NLRP3Q96P20 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
NLRP3Q96P20 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NLRP3Q96P20 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
NLRP3Q96P20 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NLRP3Q96P20 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NLRP3Q96P20 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NLRP3Q96P20 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NLRP3Q96P20 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NLRP3Q96P20 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NLRP3Q96P20 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NLRP3Q96P20 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NLRP3Q96P20 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NLRP3Q96P20 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NLRP3Q96P20 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NLRP3Q96P20 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NLRP3Q96P20 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NLRP3Q96P20 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NLRP3Q96P20 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NLRP3Q96P20 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NLRP3Q96P20 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NLRP3Q96P20 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
NLRP3Q96P20 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NLRP3Q96P20 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
NLRP3Q96P20 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NLRP3Q96P20 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
NLRP3Q96P20 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NLRP3Q96P20 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NLRP3Q96P20 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NLRP3Q96P20 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NLRP3Q96P20 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NLRP3Q96P20 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NLRP3Q96P20 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NLRP3Q96P20 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NLRP3Q96P20 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NLRP3Q96P20 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NLRP3Q96P20 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NLRP3Q96P20 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NLRP3Q96P20 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NLRP3Q96P20 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NLRP3Q96P20 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NLRP3Q96P20 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
NLRP3Q96P20 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NLRP3Q96P20 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NLRP3Q96P20 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
NLRP3Q96P20 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NLRP3Q96P20 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NLRP3Q96P20 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
NLRP3Q96P20 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NLRP3Q96P20 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NLRP3Q96P20 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NLRP3Q96P20 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NLRP3Q96P20 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NLRP3Q96P20 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NLRP3Q96P20 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NLRP3Q96P20 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NLRP3Q96P20 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NLRP3Q96P20 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NLRP3Q96P20 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NLRP3Q96P20 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NLRP3Q96P20 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NLRP3Q96P20 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NLRP3Q96P20 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NLRP3Q96P20 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NLRP3Q96P20 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
NLRP3Q96P20 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NLRP3Q96P20 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NLRP3Q96P20 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NLRP3Q96P20 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
NLRP3Q96P20 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NLRP3Q96P20 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NLRP3Q96P20 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NLRP3Q96P20 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NLRP3Q96P20 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NLRP3Q96P20 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NLRP3Q96P20 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NLRP3Q96P20 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NLRP3Q96P20 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NLRP3Q96P20 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NLRP3Q96P20 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NLRP3Q96P20 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
NLRP3Q96P20 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NLRP3Q96P20 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NLRP3Q96P20 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NLRP3Q96P20 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NLRP3Q96P20 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NLRP3Q96P20 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NLRP3Q96P20 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NLRP3Q96P20 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NLRP3Q96P20 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NLRP3Q96P20 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
NLRP3Q96P20 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
NLRP3Q96P20 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms