Protein–RNA interactions for Protein: Q96MF7

NSMCE2, E3 SUMO-protein ligase NSE2, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSMCE2Q96MF7 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NSMCE2Q96MF7 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NSMCE2Q96MF7 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NSMCE2Q96MF7 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NSMCE2Q96MF7 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NSMCE2Q96MF7 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NSMCE2Q96MF7 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NSMCE2Q96MF7 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NSMCE2Q96MF7 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NSMCE2Q96MF7 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NSMCE2Q96MF7 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NSMCE2Q96MF7 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NSMCE2Q96MF7 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NSMCE2Q96MF7 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NSMCE2Q96MF7 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NSMCE2Q96MF7 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NSMCE2Q96MF7 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NSMCE2Q96MF7 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NSMCE2Q96MF7 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NSMCE2Q96MF7 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NSMCE2Q96MF7 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NSMCE2Q96MF7 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NSMCE2Q96MF7 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NSMCE2Q96MF7 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NSMCE2Q96MF7 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
NSMCE2Q96MF7 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NSMCE2Q96MF7 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NSMCE2Q96MF7 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NSMCE2Q96MF7 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NSMCE2Q96MF7 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NSMCE2Q96MF7 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NSMCE2Q96MF7 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NSMCE2Q96MF7 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NSMCE2Q96MF7 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NSMCE2Q96MF7 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
NSMCE2Q96MF7 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NSMCE2Q96MF7 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NSMCE2Q96MF7 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.37
NSMCE2Q96MF7 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
NSMCE2Q96MF7 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
NSMCE2Q96MF7 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
NSMCE2Q96MF7 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NSMCE2Q96MF7 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NSMCE2Q96MF7 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NSMCE2Q96MF7 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NSMCE2Q96MF7 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NSMCE2Q96MF7 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NSMCE2Q96MF7 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NSMCE2Q96MF7 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NSMCE2Q96MF7 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NSMCE2Q96MF7 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
NSMCE2Q96MF7 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NSMCE2Q96MF7 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NSMCE2Q96MF7 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NSMCE2Q96MF7 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NSMCE2Q96MF7 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NSMCE2Q96MF7 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NSMCE2Q96MF7 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NSMCE2Q96MF7 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NSMCE2Q96MF7 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NSMCE2Q96MF7 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NSMCE2Q96MF7 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NSMCE2Q96MF7 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NSMCE2Q96MF7 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NSMCE2Q96MF7 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NSMCE2Q96MF7 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NSMCE2Q96MF7 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NSMCE2Q96MF7 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NSMCE2Q96MF7 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
NSMCE2Q96MF7 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NSMCE2Q96MF7 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NSMCE2Q96MF7 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NSMCE2Q96MF7 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NSMCE2Q96MF7 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
NSMCE2Q96MF7 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NSMCE2Q96MF7 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NSMCE2Q96MF7 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NSMCE2Q96MF7 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NSMCE2Q96MF7 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NSMCE2Q96MF7 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NSMCE2Q96MF7 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NSMCE2Q96MF7 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NSMCE2Q96MF7 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NSMCE2Q96MF7 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NSMCE2Q96MF7 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NSMCE2Q96MF7 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NSMCE2Q96MF7 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NSMCE2Q96MF7 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NSMCE2Q96MF7 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NSMCE2Q96MF7 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NSMCE2Q96MF7 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NSMCE2Q96MF7 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NSMCE2Q96MF7 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NSMCE2Q96MF7 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NSMCE2Q96MF7 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NSMCE2Q96MF7 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NSMCE2Q96MF7 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NSMCE2Q96MF7 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NSMCE2Q96MF7 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NSMCE2Q96MF7 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms