Protein–RNA interactions for Protein: Q96M91

CFAP53, Cilia- and flagella-associated protein 53, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP53Q96M91 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CFAP53Q96M91 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CFAP53Q96M91 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CFAP53Q96M91 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CFAP53Q96M91 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CFAP53Q96M91 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CFAP53Q96M91 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CFAP53Q96M91 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CFAP53Q96M91 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CFAP53Q96M91 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CFAP53Q96M91 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CFAP53Q96M91 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CFAP53Q96M91 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CFAP53Q96M91 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CFAP53Q96M91 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CFAP53Q96M91 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CFAP53Q96M91 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CFAP53Q96M91 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CFAP53Q96M91 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CFAP53Q96M91 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CFAP53Q96M91 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CFAP53Q96M91 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CFAP53Q96M91 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CFAP53Q96M91 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CFAP53Q96M91 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CFAP53Q96M91 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CFAP53Q96M91 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CFAP53Q96M91 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CFAP53Q96M91 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CFAP53Q96M91 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CFAP53Q96M91 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CFAP53Q96M91 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CFAP53Q96M91 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CFAP53Q96M91 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CFAP53Q96M91 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CFAP53Q96M91 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CFAP53Q96M91 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CFAP53Q96M91 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CFAP53Q96M91 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CFAP53Q96M91 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CFAP53Q96M91 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CFAP53Q96M91 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CFAP53Q96M91 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CFAP53Q96M91 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CFAP53Q96M91 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CFAP53Q96M91 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CFAP53Q96M91 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CFAP53Q96M91 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CFAP53Q96M91 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CFAP53Q96M91 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CFAP53Q96M91 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CFAP53Q96M91 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CFAP53Q96M91 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CFAP53Q96M91 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CFAP53Q96M91 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CFAP53Q96M91 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CFAP53Q96M91 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CFAP53Q96M91 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CFAP53Q96M91 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CFAP53Q96M91 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CFAP53Q96M91 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CFAP53Q96M91 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CFAP53Q96M91 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CFAP53Q96M91 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CFAP53Q96M91 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CFAP53Q96M91 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CFAP53Q96M91 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CFAP53Q96M91 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CFAP53Q96M91 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CFAP53Q96M91 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CFAP53Q96M91 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CFAP53Q96M91 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CFAP53Q96M91 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CFAP53Q96M91 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CFAP53Q96M91 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CFAP53Q96M91 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CFAP53Q96M91 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CFAP53Q96M91 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CFAP53Q96M91 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CFAP53Q96M91 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CFAP53Q96M91 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CFAP53Q96M91 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CFAP53Q96M91 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CFAP53Q96M91 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CFAP53Q96M91 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CFAP53Q96M91 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CFAP53Q96M91 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CFAP53Q96M91 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CFAP53Q96M91 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CFAP53Q96M91 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CFAP53Q96M91 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CFAP53Q96M91 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CFAP53Q96M91 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CFAP53Q96M91 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CFAP53Q96M91 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CFAP53Q96M91 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CFAP53Q96M91 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CFAP53Q96M91 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CFAP53Q96M91 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CFAP53Q96M91 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms