Protein–RNA interactions for Protein: Q96M27

PRRC1, Protein PRRC1, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRC1Q96M27 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PRRC1Q96M27 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PRRC1Q96M27 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PRRC1Q96M27 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PRRC1Q96M27 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PRRC1Q96M27 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PRRC1Q96M27 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PRRC1Q96M27 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PRRC1Q96M27 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PRRC1Q96M27 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PRRC1Q96M27 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PRRC1Q96M27 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PRRC1Q96M27 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PRRC1Q96M27 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PRRC1Q96M27 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PRRC1Q96M27 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
PRRC1Q96M27 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
PRRC1Q96M27 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PRRC1Q96M27 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PRRC1Q96M27 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PRRC1Q96M27 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
PRRC1Q96M27 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PRRC1Q96M27 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PRRC1Q96M27 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PRRC1Q96M27 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PRRC1Q96M27 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PRRC1Q96M27 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PRRC1Q96M27 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
PRRC1Q96M27 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PRRC1Q96M27 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PRRC1Q96M27 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PRRC1Q96M27 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PRRC1Q96M27 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PRRC1Q96M27 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
PRRC1Q96M27 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
PRRC1Q96M27 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PRRC1Q96M27 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PRRC1Q96M27 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PRRC1Q96M27 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
PRRC1Q96M27 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PRRC1Q96M27 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PRRC1Q96M27 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PRRC1Q96M27 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PRRC1Q96M27 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PRRC1Q96M27 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PRRC1Q96M27 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PRRC1Q96M27 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PRRC1Q96M27 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PRRC1Q96M27 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PRRC1Q96M27 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PRRC1Q96M27 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PRRC1Q96M27 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PRRC1Q96M27 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PRRC1Q96M27 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PRRC1Q96M27 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PRRC1Q96M27 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PRRC1Q96M27 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PRRC1Q96M27 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PRRC1Q96M27 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PRRC1Q96M27 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PRRC1Q96M27 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PRRC1Q96M27 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PRRC1Q96M27 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PRRC1Q96M27 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PRRC1Q96M27 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PRRC1Q96M27 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PRRC1Q96M27 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PRRC1Q96M27 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PRRC1Q96M27 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PRRC1Q96M27 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PRRC1Q96M27 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PRRC1Q96M27 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PRRC1Q96M27 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PRRC1Q96M27 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PRRC1Q96M27 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
PRRC1Q96M27 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PRRC1Q96M27 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PRRC1Q96M27 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PRRC1Q96M27 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PRRC1Q96M27 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PRRC1Q96M27 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PRRC1Q96M27 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PRRC1Q96M27 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PRRC1Q96M27 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PRRC1Q96M27 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PRRC1Q96M27 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PRRC1Q96M27 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
PRRC1Q96M27 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
PRRC1Q96M27 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PRRC1Q96M27 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PRRC1Q96M27 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PRRC1Q96M27 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PRRC1Q96M27 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PRRC1Q96M27 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PRRC1Q96M27 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PRRC1Q96M27 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PRRC1Q96M27 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PRRC1Q96M27 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PRRC1Q96M27 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PRRC1Q96M27 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms