Protein–RNA interactions for Protein: Q96J87

CELF6, CUGBP Elav-like family member 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF6Q96J87 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CELF6Q96J87 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CELF6Q96J87 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CELF6Q96J87 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CELF6Q96J87 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CELF6Q96J87 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CELF6Q96J87 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CELF6Q96J87 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CELF6Q96J87 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CELF6Q96J87 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CELF6Q96J87 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CELF6Q96J87 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CELF6Q96J87 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CELF6Q96J87 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
CELF6Q96J87 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
CELF6Q96J87 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CELF6Q96J87 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CELF6Q96J87 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CELF6Q96J87 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CELF6Q96J87 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CELF6Q96J87 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CELF6Q96J87 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CELF6Q96J87 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CELF6Q96J87 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CELF6Q96J87 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CELF6Q96J87 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CELF6Q96J87 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CELF6Q96J87 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CELF6Q96J87 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CELF6Q96J87 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CELF6Q96J87 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CELF6Q96J87 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CELF6Q96J87 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CELF6Q96J87 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CELF6Q96J87 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CELF6Q96J87 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CELF6Q96J87 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CELF6Q96J87 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CELF6Q96J87 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CELF6Q96J87 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CELF6Q96J87 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CELF6Q96J87 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CELF6Q96J87 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CELF6Q96J87 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CELF6Q96J87 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CELF6Q96J87 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CELF6Q96J87 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CELF6Q96J87 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CELF6Q96J87 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CELF6Q96J87 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CELF6Q96J87 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CELF6Q96J87 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CELF6Q96J87 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CELF6Q96J87 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CELF6Q96J87 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CELF6Q96J87 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CELF6Q96J87 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CELF6Q96J87 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CELF6Q96J87 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CELF6Q96J87 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CELF6Q96J87 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CELF6Q96J87 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CELF6Q96J87 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CELF6Q96J87 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CELF6Q96J87 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CELF6Q96J87 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CELF6Q96J87 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CELF6Q96J87 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CELF6Q96J87 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CELF6Q96J87 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CELF6Q96J87 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CELF6Q96J87 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CELF6Q96J87 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CELF6Q96J87 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CELF6Q96J87 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CELF6Q96J87 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CELF6Q96J87 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CELF6Q96J87 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CELF6Q96J87 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CELF6Q96J87 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CELF6Q96J87 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CELF6Q96J87 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
CELF6Q96J87 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CELF6Q96J87 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CELF6Q96J87 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
CELF6Q96J87 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CELF6Q96J87 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CELF6Q96J87 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CELF6Q96J87 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
CELF6Q96J87 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CELF6Q96J87 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CELF6Q96J87 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CELF6Q96J87 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CELF6Q96J87 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CELF6Q96J87 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CELF6Q96J87 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CELF6Q96J87 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CELF6Q96J87 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CELF6Q96J87 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CELF6Q96J87 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms