Protein–RNA interactions for Protein: Q96FN4

CPNE2, Copine-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 548 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPNE2Q96FN4 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CPNE2Q96FN4 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CPNE2Q96FN4 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CPNE2Q96FN4 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CPNE2Q96FN4 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CPNE2Q96FN4 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CPNE2Q96FN4 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CPNE2Q96FN4 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CPNE2Q96FN4 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CPNE2Q96FN4 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CPNE2Q96FN4 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CPNE2Q96FN4 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CPNE2Q96FN4 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CPNE2Q96FN4 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CPNE2Q96FN4 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CPNE2Q96FN4 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CPNE2Q96FN4 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CPNE2Q96FN4 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CPNE2Q96FN4 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CPNE2Q96FN4 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CPNE2Q96FN4 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CPNE2Q96FN4 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CPNE2Q96FN4 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CPNE2Q96FN4 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CPNE2Q96FN4 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CPNE2Q96FN4 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CPNE2Q96FN4 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CPNE2Q96FN4 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CPNE2Q96FN4 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CPNE2Q96FN4 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CPNE2Q96FN4 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CPNE2Q96FN4 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CPNE2Q96FN4 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CPNE2Q96FN4 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CPNE2Q96FN4 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CPNE2Q96FN4 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CPNE2Q96FN4 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CPNE2Q96FN4 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
CPNE2Q96FN4 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
CPNE2Q96FN4 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CPNE2Q96FN4 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CPNE2Q96FN4 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CPNE2Q96FN4 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CPNE2Q96FN4 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CPNE2Q96FN4 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CPNE2Q96FN4 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CPNE2Q96FN4 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CPNE2Q96FN4 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CPNE2Q96FN4 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CPNE2Q96FN4 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CPNE2Q96FN4 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CPNE2Q96FN4 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CPNE2Q96FN4 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CPNE2Q96FN4 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CPNE2Q96FN4 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CPNE2Q96FN4 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CPNE2Q96FN4 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CPNE2Q96FN4 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CPNE2Q96FN4 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CPNE2Q96FN4 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CPNE2Q96FN4 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CPNE2Q96FN4 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CPNE2Q96FN4 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CPNE2Q96FN4 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CPNE2Q96FN4 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CPNE2Q96FN4 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CPNE2Q96FN4 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CPNE2Q96FN4 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CPNE2Q96FN4 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CPNE2Q96FN4 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CPNE2Q96FN4 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CPNE2Q96FN4 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CPNE2Q96FN4 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CPNE2Q96FN4 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CPNE2Q96FN4 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CPNE2Q96FN4 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CPNE2Q96FN4 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CPNE2Q96FN4 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CPNE2Q96FN4 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CPNE2Q96FN4 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CPNE2Q96FN4 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CPNE2Q96FN4 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CPNE2Q96FN4 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CPNE2Q96FN4 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CPNE2Q96FN4 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CPNE2Q96FN4 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CPNE2Q96FN4 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CPNE2Q96FN4 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CPNE2Q96FN4 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CPNE2Q96FN4 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CPNE2Q96FN4 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CPNE2Q96FN4 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CPNE2Q96FN4 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CPNE2Q96FN4 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CPNE2Q96FN4 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CPNE2Q96FN4 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CPNE2Q96FN4 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CPNE2Q96FN4 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CPNE2Q96FN4 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CPNE2Q96FN4 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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