Protein–RNA interactions for Protein: Q96ER9

CCDC51, Coiled-coil domain-containing protein 51, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC51Q96ER9 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC51Q96ER9 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC51Q96ER9 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC51Q96ER9 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC51Q96ER9 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC51Q96ER9 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC51Q96ER9 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC51Q96ER9 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC51Q96ER9 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC51Q96ER9 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC51Q96ER9 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC51Q96ER9 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC51Q96ER9 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC51Q96ER9 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC51Q96ER9 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC51Q96ER9 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC51Q96ER9 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC51Q96ER9 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC51Q96ER9 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC51Q96ER9 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC51Q96ER9 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC51Q96ER9 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC51Q96ER9 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC51Q96ER9 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC51Q96ER9 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC51Q96ER9 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC51Q96ER9 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC51Q96ER9 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC51Q96ER9 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC51Q96ER9 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC51Q96ER9 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC51Q96ER9 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC51Q96ER9 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC51Q96ER9 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC51Q96ER9 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC51Q96ER9 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC51Q96ER9 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC51Q96ER9 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC51Q96ER9 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC51Q96ER9 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC51Q96ER9 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC51Q96ER9 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC51Q96ER9 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC51Q96ER9 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC51Q96ER9 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC51Q96ER9 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC51Q96ER9 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC51Q96ER9 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC51Q96ER9 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC51Q96ER9 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC51Q96ER9 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC51Q96ER9 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC51Q96ER9 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC51Q96ER9 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC51Q96ER9 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC51Q96ER9 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC51Q96ER9 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC51Q96ER9 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC51Q96ER9 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC51Q96ER9 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC51Q96ER9 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC51Q96ER9 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC51Q96ER9 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC51Q96ER9 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC51Q96ER9 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC51Q96ER9 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC51Q96ER9 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC51Q96ER9 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC51Q96ER9 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC51Q96ER9 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC51Q96ER9 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC51Q96ER9 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC51Q96ER9 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC51Q96ER9 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC51Q96ER9 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC51Q96ER9 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC51Q96ER9 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC51Q96ER9 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC51Q96ER9 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC51Q96ER9 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC51Q96ER9 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC51Q96ER9 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC51Q96ER9 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC51Q96ER9 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC51Q96ER9 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC51Q96ER9 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC51Q96ER9 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC51Q96ER9 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC51Q96ER9 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC51Q96ER9 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC51Q96ER9 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC51Q96ER9 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC51Q96ER9 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC51Q96ER9 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC51Q96ER9 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC51Q96ER9 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC51Q96ER9 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC51Q96ER9 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC51Q96ER9 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC51Q96ER9 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.2 ms