Protein–RNA interactions for Protein: Q96CM3

RPUSD4, Mitochondrial RNA pseudouridine synthase RPUSD4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD4Q96CM3 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RPUSD4Q96CM3 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RPUSD4Q96CM3 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RPUSD4Q96CM3 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RPUSD4Q96CM3 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RPUSD4Q96CM3 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RPUSD4Q96CM3 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RPUSD4Q96CM3 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RPUSD4Q96CM3 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
RPUSD4Q96CM3 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RPUSD4Q96CM3 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
RPUSD4Q96CM3 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RPUSD4Q96CM3 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RPUSD4Q96CM3 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RPUSD4Q96CM3 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RPUSD4Q96CM3 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RPUSD4Q96CM3 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RPUSD4Q96CM3 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RPUSD4Q96CM3 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RPUSD4Q96CM3 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
RPUSD4Q96CM3 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RPUSD4Q96CM3 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RPUSD4Q96CM3 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RPUSD4Q96CM3 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RPUSD4Q96CM3 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPUSD4Q96CM3 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPUSD4Q96CM3 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPUSD4Q96CM3 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPUSD4Q96CM3 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPUSD4Q96CM3 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPUSD4Q96CM3 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPUSD4Q96CM3 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPUSD4Q96CM3 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPUSD4Q96CM3 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
RPUSD4Q96CM3 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPUSD4Q96CM3 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPUSD4Q96CM3 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPUSD4Q96CM3 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPUSD4Q96CM3 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPUSD4Q96CM3 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPUSD4Q96CM3 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPUSD4Q96CM3 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPUSD4Q96CM3 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPUSD4Q96CM3 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPUSD4Q96CM3 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPUSD4Q96CM3 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPUSD4Q96CM3 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPUSD4Q96CM3 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPUSD4Q96CM3 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
RPUSD4Q96CM3 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
RPUSD4Q96CM3 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPUSD4Q96CM3 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPUSD4Q96CM3 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPUSD4Q96CM3 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPUSD4Q96CM3 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPUSD4Q96CM3 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPUSD4Q96CM3 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPUSD4Q96CM3 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPUSD4Q96CM3 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPUSD4Q96CM3 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPUSD4Q96CM3 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPUSD4Q96CM3 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPUSD4Q96CM3 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPUSD4Q96CM3 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPUSD4Q96CM3 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPUSD4Q96CM3 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPUSD4Q96CM3 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPUSD4Q96CM3 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPUSD4Q96CM3 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPUSD4Q96CM3 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPUSD4Q96CM3 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPUSD4Q96CM3 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
RPUSD4Q96CM3 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPUSD4Q96CM3 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPUSD4Q96CM3 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RPUSD4Q96CM3 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RPUSD4Q96CM3 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RPUSD4Q96CM3 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RPUSD4Q96CM3 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RPUSD4Q96CM3 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RPUSD4Q96CM3 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RPUSD4Q96CM3 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RPUSD4Q96CM3 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RPUSD4Q96CM3 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RPUSD4Q96CM3 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RPUSD4Q96CM3 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RPUSD4Q96CM3 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RPUSD4Q96CM3 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RPUSD4Q96CM3 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RPUSD4Q96CM3 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
RPUSD4Q96CM3 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RPUSD4Q96CM3 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RPUSD4Q96CM3 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RPUSD4Q96CM3 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RPUSD4Q96CM3 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RPUSD4Q96CM3 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RPUSD4Q96CM3 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
RPUSD4Q96CM3 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RPUSD4Q96CM3 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RPUSD4Q96CM3 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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