Protein–RNA interactions for Protein: Q96CJ1

EAF2, ELL-associated factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EAF2Q96CJ1 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EAF2Q96CJ1 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EAF2Q96CJ1 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EAF2Q96CJ1 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EAF2Q96CJ1 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EAF2Q96CJ1 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EAF2Q96CJ1 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EAF2Q96CJ1 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EAF2Q96CJ1 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EAF2Q96CJ1 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
EAF2Q96CJ1 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EAF2Q96CJ1 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EAF2Q96CJ1 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
EAF2Q96CJ1 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EAF2Q96CJ1 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EAF2Q96CJ1 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EAF2Q96CJ1 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EAF2Q96CJ1 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EAF2Q96CJ1 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EAF2Q96CJ1 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EAF2Q96CJ1 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EAF2Q96CJ1 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EAF2Q96CJ1 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EAF2Q96CJ1 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EAF2Q96CJ1 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EAF2Q96CJ1 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EAF2Q96CJ1 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EAF2Q96CJ1 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EAF2Q96CJ1 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EAF2Q96CJ1 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EAF2Q96CJ1 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EAF2Q96CJ1 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EAF2Q96CJ1 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EAF2Q96CJ1 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EAF2Q96CJ1 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EAF2Q96CJ1 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EAF2Q96CJ1 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EAF2Q96CJ1 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
EAF2Q96CJ1 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EAF2Q96CJ1 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EAF2Q96CJ1 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EAF2Q96CJ1 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EAF2Q96CJ1 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EAF2Q96CJ1 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EAF2Q96CJ1 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EAF2Q96CJ1 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EAF2Q96CJ1 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EAF2Q96CJ1 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EAF2Q96CJ1 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EAF2Q96CJ1 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EAF2Q96CJ1 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EAF2Q96CJ1 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EAF2Q96CJ1 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EAF2Q96CJ1 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EAF2Q96CJ1 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EAF2Q96CJ1 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EAF2Q96CJ1 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EAF2Q96CJ1 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EAF2Q96CJ1 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EAF2Q96CJ1 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EAF2Q96CJ1 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EAF2Q96CJ1 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EAF2Q96CJ1 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EAF2Q96CJ1 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EAF2Q96CJ1 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EAF2Q96CJ1 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EAF2Q96CJ1 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EAF2Q96CJ1 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EAF2Q96CJ1 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EAF2Q96CJ1 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EAF2Q96CJ1 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EAF2Q96CJ1 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
EAF2Q96CJ1 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EAF2Q96CJ1 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EAF2Q96CJ1 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EAF2Q96CJ1 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EAF2Q96CJ1 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EAF2Q96CJ1 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EAF2Q96CJ1 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
EAF2Q96CJ1 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EAF2Q96CJ1 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EAF2Q96CJ1 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EAF2Q96CJ1 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EAF2Q96CJ1 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
EAF2Q96CJ1 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EAF2Q96CJ1 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EAF2Q96CJ1 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EAF2Q96CJ1 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EAF2Q96CJ1 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EAF2Q96CJ1 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EAF2Q96CJ1 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EAF2Q96CJ1 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EAF2Q96CJ1 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EAF2Q96CJ1 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EAF2Q96CJ1 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EAF2Q96CJ1 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
EAF2Q96CJ1 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EAF2Q96CJ1 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EAF2Q96CJ1 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EAF2Q96CJ1 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms