Protein–RNA interactions for Protein: Q96CG8

CTHRC1, Collagen triple helix repeat-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTHRC1Q96CG8 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTHRC1Q96CG8 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTHRC1Q96CG8 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTHRC1Q96CG8 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTHRC1Q96CG8 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTHRC1Q96CG8 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTHRC1Q96CG8 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTHRC1Q96CG8 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CTHRC1Q96CG8 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CTHRC1Q96CG8 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CTHRC1Q96CG8 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTHRC1Q96CG8 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CTHRC1Q96CG8 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CTHRC1Q96CG8 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTHRC1Q96CG8 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTHRC1Q96CG8 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CTHRC1Q96CG8 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CTHRC1Q96CG8 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTHRC1Q96CG8 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTHRC1Q96CG8 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTHRC1Q96CG8 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTHRC1Q96CG8 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTHRC1Q96CG8 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTHRC1Q96CG8 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTHRC1Q96CG8 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTHRC1Q96CG8 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTHRC1Q96CG8 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTHRC1Q96CG8 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTHRC1Q96CG8 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTHRC1Q96CG8 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTHRC1Q96CG8 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTHRC1Q96CG8 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTHRC1Q96CG8 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTHRC1Q96CG8 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTHRC1Q96CG8 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTHRC1Q96CG8 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTHRC1Q96CG8 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTHRC1Q96CG8 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTHRC1Q96CG8 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTHRC1Q96CG8 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTHRC1Q96CG8 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTHRC1Q96CG8 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTHRC1Q96CG8 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTHRC1Q96CG8 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTHRC1Q96CG8 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTHRC1Q96CG8 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTHRC1Q96CG8 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTHRC1Q96CG8 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTHRC1Q96CG8 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTHRC1Q96CG8 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTHRC1Q96CG8 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTHRC1Q96CG8 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTHRC1Q96CG8 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTHRC1Q96CG8 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTHRC1Q96CG8 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTHRC1Q96CG8 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTHRC1Q96CG8 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTHRC1Q96CG8 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTHRC1Q96CG8 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTHRC1Q96CG8 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTHRC1Q96CG8 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTHRC1Q96CG8 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTHRC1Q96CG8 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTHRC1Q96CG8 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTHRC1Q96CG8 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTHRC1Q96CG8 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTHRC1Q96CG8 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTHRC1Q96CG8 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTHRC1Q96CG8 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTHRC1Q96CG8 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTHRC1Q96CG8 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTHRC1Q96CG8 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CTHRC1Q96CG8 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTHRC1Q96CG8 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTHRC1Q96CG8 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTHRC1Q96CG8 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CTHRC1Q96CG8 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTHRC1Q96CG8 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTHRC1Q96CG8 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTHRC1Q96CG8 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTHRC1Q96CG8 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTHRC1Q96CG8 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTHRC1Q96CG8 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTHRC1Q96CG8 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTHRC1Q96CG8 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTHRC1Q96CG8 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTHRC1Q96CG8 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTHRC1Q96CG8 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CTHRC1Q96CG8 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTHRC1Q96CG8 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTHRC1Q96CG8 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTHRC1Q96CG8 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTHRC1Q96CG8 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTHRC1Q96CG8 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTHRC1Q96CG8 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTHRC1Q96CG8 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CTHRC1Q96CG8 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CTHRC1Q96CG8 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CTHRC1Q96CG8 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CTHRC1Q96CG8 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms