Protein–RNA interactions for Protein: Q969W0

SPTSSA, Serine palmitoyltransferase small subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 71 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTSSAQ969W0 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPTSSAQ969W0 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPTSSAQ969W0 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPTSSAQ969W0 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPTSSAQ969W0 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPTSSAQ969W0 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPTSSAQ969W0 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPTSSAQ969W0 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SPTSSAQ969W0 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPTSSAQ969W0 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPTSSAQ969W0 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPTSSAQ969W0 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPTSSAQ969W0 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPTSSAQ969W0 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPTSSAQ969W0 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPTSSAQ969W0 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SPTSSAQ969W0 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPTSSAQ969W0 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPTSSAQ969W0 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SPTSSAQ969W0 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPTSSAQ969W0 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPTSSAQ969W0 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPTSSAQ969W0 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPTSSAQ969W0 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPTSSAQ969W0 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPTSSAQ969W0 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPTSSAQ969W0 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SPTSSAQ969W0 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPTSSAQ969W0 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SPTSSAQ969W0 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SPTSSAQ969W0 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SPTSSAQ969W0 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SPTSSAQ969W0 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
SPTSSAQ969W0 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPTSSAQ969W0 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPTSSAQ969W0 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPTSSAQ969W0 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPTSSAQ969W0 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPTSSAQ969W0 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPTSSAQ969W0 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SPTSSAQ969W0 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPTSSAQ969W0 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPTSSAQ969W0 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SPTSSAQ969W0 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPTSSAQ969W0 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPTSSAQ969W0 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPTSSAQ969W0 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPTSSAQ969W0 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPTSSAQ969W0 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPTSSAQ969W0 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPTSSAQ969W0 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPTSSAQ969W0 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SPTSSAQ969W0 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPTSSAQ969W0 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPTSSAQ969W0 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPTSSAQ969W0 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPTSSAQ969W0 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPTSSAQ969W0 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPTSSAQ969W0 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPTSSAQ969W0 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPTSSAQ969W0 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPTSSAQ969W0 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPTSSAQ969W0 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPTSSAQ969W0 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPTSSAQ969W0 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SPTSSAQ969W0 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPTSSAQ969W0 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPTSSAQ969W0 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPTSSAQ969W0 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPTSSAQ969W0 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPTSSAQ969W0 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPTSSAQ969W0 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPTSSAQ969W0 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPTSSAQ969W0 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPTSSAQ969W0 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPTSSAQ969W0 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPTSSAQ969W0 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SPTSSAQ969W0 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPTSSAQ969W0 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPTSSAQ969W0 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPTSSAQ969W0 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPTSSAQ969W0 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPTSSAQ969W0 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPTSSAQ969W0 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPTSSAQ969W0 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPTSSAQ969W0 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPTSSAQ969W0 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPTSSAQ969W0 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPTSSAQ969W0 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPTSSAQ969W0 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPTSSAQ969W0 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPTSSAQ969W0 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPTSSAQ969W0 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPTSSAQ969W0 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPTSSAQ969W0 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPTSSAQ969W0 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPTSSAQ969W0 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPTSSAQ969W0 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPTSSAQ969W0 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPTSSAQ969W0 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms