Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXA3

RUFY2, RUN and FYVE domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY2Q8WXA3 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RUFY2Q8WXA3 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RUFY2Q8WXA3 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
RUFY2Q8WXA3 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RUFY2Q8WXA3 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RUFY2Q8WXA3 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RUFY2Q8WXA3 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RUFY2Q8WXA3 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RUFY2Q8WXA3 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RUFY2Q8WXA3 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RUFY2Q8WXA3 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RUFY2Q8WXA3 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RUFY2Q8WXA3 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RUFY2Q8WXA3 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RUFY2Q8WXA3 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RUFY2Q8WXA3 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RUFY2Q8WXA3 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RUFY2Q8WXA3 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RUFY2Q8WXA3 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RUFY2Q8WXA3 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RUFY2Q8WXA3 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RUFY2Q8WXA3 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RUFY2Q8WXA3 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RUFY2Q8WXA3 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RUFY2Q8WXA3 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RUFY2Q8WXA3 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RUFY2Q8WXA3 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RUFY2Q8WXA3 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RUFY2Q8WXA3 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RUFY2Q8WXA3 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RUFY2Q8WXA3 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RUFY2Q8WXA3 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
RUFY2Q8WXA3 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RUFY2Q8WXA3 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
RUFY2Q8WXA3 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
RUFY2Q8WXA3 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RUFY2Q8WXA3 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RUFY2Q8WXA3 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RUFY2Q8WXA3 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RUFY2Q8WXA3 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RUFY2Q8WXA3 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RUFY2Q8WXA3 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RUFY2Q8WXA3 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RUFY2Q8WXA3 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RUFY2Q8WXA3 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RUFY2Q8WXA3 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RUFY2Q8WXA3 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RUFY2Q8WXA3 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
RUFY2Q8WXA3 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RUFY2Q8WXA3 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RUFY2Q8WXA3 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RUFY2Q8WXA3 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
RUFY2Q8WXA3 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RUFY2Q8WXA3 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RUFY2Q8WXA3 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RUFY2Q8WXA3 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RUFY2Q8WXA3 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RUFY2Q8WXA3 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RUFY2Q8WXA3 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RUFY2Q8WXA3 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RUFY2Q8WXA3 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RUFY2Q8WXA3 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RUFY2Q8WXA3 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RUFY2Q8WXA3 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RUFY2Q8WXA3 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RUFY2Q8WXA3 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RUFY2Q8WXA3 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RUFY2Q8WXA3 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RUFY2Q8WXA3 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RUFY2Q8WXA3 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RUFY2Q8WXA3 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RUFY2Q8WXA3 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RUFY2Q8WXA3 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RUFY2Q8WXA3 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RUFY2Q8WXA3 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RUFY2Q8WXA3 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RUFY2Q8WXA3 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RUFY2Q8WXA3 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RUFY2Q8WXA3 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RUFY2Q8WXA3 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RUFY2Q8WXA3 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RUFY2Q8WXA3 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RUFY2Q8WXA3 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RUFY2Q8WXA3 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RUFY2Q8WXA3 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RUFY2Q8WXA3 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RUFY2Q8WXA3 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RUFY2Q8WXA3 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RUFY2Q8WXA3 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RUFY2Q8WXA3 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RUFY2Q8WXA3 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RUFY2Q8WXA3 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RUFY2Q8WXA3 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RUFY2Q8WXA3 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RUFY2Q8WXA3 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RUFY2Q8WXA3 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RUFY2Q8WXA3 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RUFY2Q8WXA3 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RUFY2Q8WXA3 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RUFY2Q8WXA3 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms