Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDD1

DDX54, ATP-dependent RNA helicase DDX54, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 881 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX54Q8TDD1 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
DDX54Q8TDD1 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DDX54Q8TDD1 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DDX54Q8TDD1 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DDX54Q8TDD1 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DDX54Q8TDD1 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DDX54Q8TDD1 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DDX54Q8TDD1 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DDX54Q8TDD1 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
DDX54Q8TDD1 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DDX54Q8TDD1 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DDX54Q8TDD1 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
DDX54Q8TDD1 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
DDX54Q8TDD1 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
DDX54Q8TDD1 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DDX54Q8TDD1 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
DDX54Q8TDD1 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
DDX54Q8TDD1 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
DDX54Q8TDD1 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
DDX54Q8TDD1 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DDX54Q8TDD1 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DDX54Q8TDD1 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
DDX54Q8TDD1 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DDX54Q8TDD1 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DDX54Q8TDD1 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
DDX54Q8TDD1 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
DDX54Q8TDD1 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
DDX54Q8TDD1 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DDX54Q8TDD1 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
DDX54Q8TDD1 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
DDX54Q8TDD1 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
DDX54Q8TDD1 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
DDX54Q8TDD1 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
DDX54Q8TDD1 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
DDX54Q8TDD1 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
DDX54Q8TDD1 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
DDX54Q8TDD1 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
DDX54Q8TDD1 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
DDX54Q8TDD1 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
DDX54Q8TDD1 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
DDX54Q8TDD1 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
DDX54Q8TDD1 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
DDX54Q8TDD1 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
DDX54Q8TDD1 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
DDX54Q8TDD1 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
DDX54Q8TDD1 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
DDX54Q8TDD1 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
DDX54Q8TDD1 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
DDX54Q8TDD1 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
DDX54Q8TDD1 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
DDX54Q8TDD1 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
DDX54Q8TDD1 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
DDX54Q8TDD1 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
DDX54Q8TDD1 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
DDX54Q8TDD1 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
DDX54Q8TDD1 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
DDX54Q8TDD1 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
DDX54Q8TDD1 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
DDX54Q8TDD1 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
DDX54Q8TDD1 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
DDX54Q8TDD1 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
DDX54Q8TDD1 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
DDX54Q8TDD1 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
DDX54Q8TDD1 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
DDX54Q8TDD1 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
DDX54Q8TDD1 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
DDX54Q8TDD1 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
DDX54Q8TDD1 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
DDX54Q8TDD1 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
DDX54Q8TDD1 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
DDX54Q8TDD1 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
DDX54Q8TDD1 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
DDX54Q8TDD1 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
DDX54Q8TDD1 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
DDX54Q8TDD1 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
DDX54Q8TDD1 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
DDX54Q8TDD1 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
DDX54Q8TDD1 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
DDX54Q8TDD1 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
DDX54Q8TDD1 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
DDX54Q8TDD1 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
DDX54Q8TDD1 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
DDX54Q8TDD1 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
DDX54Q8TDD1 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
DDX54Q8TDD1 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
DDX54Q8TDD1 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
DDX54Q8TDD1 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
DDX54Q8TDD1 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
DDX54Q8TDD1 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
DDX54Q8TDD1 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
DDX54Q8TDD1 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
DDX54Q8TDD1 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
DDX54Q8TDD1 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
DDX54Q8TDD1 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
DDX54Q8TDD1 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
DDX54Q8TDD1 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
DDX54Q8TDD1 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
DDX54Q8TDD1 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
DDX54Q8TDD1 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
DDX54Q8TDD1 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.6 ms