Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA58

PNLDC1, Poly(A)-specific ribonuclease PNLDC1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNLDC1Q8NA58 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PNLDC1Q8NA58 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PNLDC1Q8NA58 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PNLDC1Q8NA58 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PNLDC1Q8NA58 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PNLDC1Q8NA58 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PNLDC1Q8NA58 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PNLDC1Q8NA58 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PNLDC1Q8NA58 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PNLDC1Q8NA58 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PNLDC1Q8NA58 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PNLDC1Q8NA58 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PNLDC1Q8NA58 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PNLDC1Q8NA58 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PNLDC1Q8NA58 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PNLDC1Q8NA58 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PNLDC1Q8NA58 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PNLDC1Q8NA58 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PNLDC1Q8NA58 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PNLDC1Q8NA58 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PNLDC1Q8NA58 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PNLDC1Q8NA58 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PNLDC1Q8NA58 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PNLDC1Q8NA58 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PNLDC1Q8NA58 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PNLDC1Q8NA58 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PNLDC1Q8NA58 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PNLDC1Q8NA58 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PNLDC1Q8NA58 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PNLDC1Q8NA58 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PNLDC1Q8NA58 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PNLDC1Q8NA58 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PNLDC1Q8NA58 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PNLDC1Q8NA58 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PNLDC1Q8NA58 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PNLDC1Q8NA58 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PNLDC1Q8NA58 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PNLDC1Q8NA58 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PNLDC1Q8NA58 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PNLDC1Q8NA58 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PNLDC1Q8NA58 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PNLDC1Q8NA58 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PNLDC1Q8NA58 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PNLDC1Q8NA58 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PNLDC1Q8NA58 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PNLDC1Q8NA58 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PNLDC1Q8NA58 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PNLDC1Q8NA58 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PNLDC1Q8NA58 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PNLDC1Q8NA58 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PNLDC1Q8NA58 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PNLDC1Q8NA58 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PNLDC1Q8NA58 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PNLDC1Q8NA58 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PNLDC1Q8NA58 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PNLDC1Q8NA58 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PNLDC1Q8NA58 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PNLDC1Q8NA58 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PNLDC1Q8NA58 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PNLDC1Q8NA58 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PNLDC1Q8NA58 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PNLDC1Q8NA58 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PNLDC1Q8NA58 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PNLDC1Q8NA58 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PNLDC1Q8NA58 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PNLDC1Q8NA58 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PNLDC1Q8NA58 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PNLDC1Q8NA58 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PNLDC1Q8NA58 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PNLDC1Q8NA58 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PNLDC1Q8NA58 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PNLDC1Q8NA58 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PNLDC1Q8NA58 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PNLDC1Q8NA58 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PNLDC1Q8NA58 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PNLDC1Q8NA58 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PNLDC1Q8NA58 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PNLDC1Q8NA58 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PNLDC1Q8NA58 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PNLDC1Q8NA58 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PNLDC1Q8NA58 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PNLDC1Q8NA58 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PNLDC1Q8NA58 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PNLDC1Q8NA58 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PNLDC1Q8NA58 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PNLDC1Q8NA58 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PNLDC1Q8NA58 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PNLDC1Q8NA58 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PNLDC1Q8NA58 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PNLDC1Q8NA58 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PNLDC1Q8NA58 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PNLDC1Q8NA58 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PNLDC1Q8NA58 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PNLDC1Q8NA58 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PNLDC1Q8NA58 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PNLDC1Q8NA58 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PNLDC1Q8NA58 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PNLDC1Q8NA58 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PNLDC1Q8NA58 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PNLDC1Q8NA58 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms