Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F1

CLDN19, Claudin-19, humanhuman

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN19Q8N6F1 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLDN19Q8N6F1 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLDN19Q8N6F1 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLDN19Q8N6F1 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLDN19Q8N6F1 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLDN19Q8N6F1 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLDN19Q8N6F1 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLDN19Q8N6F1 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CLDN19Q8N6F1 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLDN19Q8N6F1 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLDN19Q8N6F1 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLDN19Q8N6F1 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLDN19Q8N6F1 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLDN19Q8N6F1 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLDN19Q8N6F1 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLDN19Q8N6F1 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLDN19Q8N6F1 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLDN19Q8N6F1 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLDN19Q8N6F1 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLDN19Q8N6F1 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CLDN19Q8N6F1 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CLDN19Q8N6F1 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLDN19Q8N6F1 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLDN19Q8N6F1 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLDN19Q8N6F1 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLDN19Q8N6F1 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLDN19Q8N6F1 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLDN19Q8N6F1 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLDN19Q8N6F1 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLDN19Q8N6F1 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLDN19Q8N6F1 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLDN19Q8N6F1 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLDN19Q8N6F1 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLDN19Q8N6F1 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLDN19Q8N6F1 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLDN19Q8N6F1 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLDN19Q8N6F1 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLDN19Q8N6F1 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLDN19Q8N6F1 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLDN19Q8N6F1 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLDN19Q8N6F1 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CLDN19Q8N6F1 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CLDN19Q8N6F1 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CLDN19Q8N6F1 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CLDN19Q8N6F1 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CLDN19Q8N6F1 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CLDN19Q8N6F1 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLDN19Q8N6F1 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLDN19Q8N6F1 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLDN19Q8N6F1 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLDN19Q8N6F1 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLDN19Q8N6F1 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CLDN19Q8N6F1 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CLDN19Q8N6F1 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLDN19Q8N6F1 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
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CLDN19Q8N6F1 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLDN19Q8N6F1 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
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CLDN19Q8N6F1 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLDN19Q8N6F1 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLDN19Q8N6F1 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLDN19Q8N6F1 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLDN19Q8N6F1 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLDN19Q8N6F1 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLDN19Q8N6F1 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLDN19Q8N6F1 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLDN19Q8N6F1 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLDN19Q8N6F1 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLDN19Q8N6F1 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLDN19Q8N6F1 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLDN19Q8N6F1 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLDN19Q8N6F1 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLDN19Q8N6F1 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLDN19Q8N6F1 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLDN19Q8N6F1 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLDN19Q8N6F1 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLDN19Q8N6F1 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLDN19Q8N6F1 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLDN19Q8N6F1 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLDN19Q8N6F1 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLDN19Q8N6F1 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLDN19Q8N6F1 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLDN19Q8N6F1 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLDN19Q8N6F1 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLDN19Q8N6F1 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLDN19Q8N6F1 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLDN19Q8N6F1 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLDN19Q8N6F1 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLDN19Q8N6F1 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLDN19Q8N6F1 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CLDN19Q8N6F1 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CLDN19Q8N6F1 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CLDN19Q8N6F1 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLDN19Q8N6F1 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLDN19Q8N6F1 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLDN19Q8N6F1 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLDN19Q8N6F1 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLDN19Q8N6F1 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLDN19Q8N6F1 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
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