Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4Q1

CHCHD4, Mitochondrial intermembrane space import and assembly protein 40, humanhuman

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Length 142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD4Q8N4Q1 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHCHD4Q8N4Q1 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHCHD4Q8N4Q1 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHCHD4Q8N4Q1 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHCHD4Q8N4Q1 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHCHD4Q8N4Q1 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHCHD4Q8N4Q1 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHCHD4Q8N4Q1 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHCHD4Q8N4Q1 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CHCHD4Q8N4Q1 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHCHD4Q8N4Q1 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHCHD4Q8N4Q1 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHCHD4Q8N4Q1 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CHCHD4Q8N4Q1 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHCHD4Q8N4Q1 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CHCHD4Q8N4Q1 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHCHD4Q8N4Q1 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHCHD4Q8N4Q1 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHCHD4Q8N4Q1 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHCHD4Q8N4Q1 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHCHD4Q8N4Q1 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHCHD4Q8N4Q1 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CHCHD4Q8N4Q1 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHCHD4Q8N4Q1 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHCHD4Q8N4Q1 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHCHD4Q8N4Q1 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHCHD4Q8N4Q1 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHCHD4Q8N4Q1 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHCHD4Q8N4Q1 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHCHD4Q8N4Q1 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHCHD4Q8N4Q1 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHCHD4Q8N4Q1 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHCHD4Q8N4Q1 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHCHD4Q8N4Q1 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHCHD4Q8N4Q1 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHCHD4Q8N4Q1 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHCHD4Q8N4Q1 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHCHD4Q8N4Q1 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHCHD4Q8N4Q1 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHCHD4Q8N4Q1 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHCHD4Q8N4Q1 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHCHD4Q8N4Q1 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHCHD4Q8N4Q1 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHCHD4Q8N4Q1 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHCHD4Q8N4Q1 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHCHD4Q8N4Q1 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHCHD4Q8N4Q1 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHCHD4Q8N4Q1 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHCHD4Q8N4Q1 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHCHD4Q8N4Q1 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHCHD4Q8N4Q1 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHCHD4Q8N4Q1 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHCHD4Q8N4Q1 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHCHD4Q8N4Q1 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHCHD4Q8N4Q1 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHCHD4Q8N4Q1 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHCHD4Q8N4Q1 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHCHD4Q8N4Q1 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHCHD4Q8N4Q1 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHCHD4Q8N4Q1 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHCHD4Q8N4Q1 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHCHD4Q8N4Q1 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CHCHD4Q8N4Q1 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHCHD4Q8N4Q1 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHCHD4Q8N4Q1 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHCHD4Q8N4Q1 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHCHD4Q8N4Q1 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHCHD4Q8N4Q1 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHCHD4Q8N4Q1 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CHCHD4Q8N4Q1 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHCHD4Q8N4Q1 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
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CHCHD4Q8N4Q1 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHCHD4Q8N4Q1 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CHCHD4Q8N4Q1 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHCHD4Q8N4Q1 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHCHD4Q8N4Q1 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHCHD4Q8N4Q1 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHCHD4Q8N4Q1 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHCHD4Q8N4Q1 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHCHD4Q8N4Q1 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHCHD4Q8N4Q1 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHCHD4Q8N4Q1 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHCHD4Q8N4Q1 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHCHD4Q8N4Q1 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CHCHD4Q8N4Q1 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHCHD4Q8N4Q1 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CHCHD4Q8N4Q1 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHCHD4Q8N4Q1 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHCHD4Q8N4Q1 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHCHD4Q8N4Q1 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHCHD4Q8N4Q1 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHCHD4Q8N4Q1 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHCHD4Q8N4Q1 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHCHD4Q8N4Q1 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHCHD4Q8N4Q1 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHCHD4Q8N4Q1 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHCHD4Q8N4Q1 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
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