Protein–RNA interactions for Protein: Q8N283

ANKRD35, Ankyrin repeat domain-containing protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 1,001 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD35Q8N283 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ANKRD35Q8N283 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ANKRD35Q8N283 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ANKRD35Q8N283 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ANKRD35Q8N283 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ANKRD35Q8N283 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ANKRD35Q8N283 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ANKRD35Q8N283 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ANKRD35Q8N283 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ANKRD35Q8N283 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ANKRD35Q8N283 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ANKRD35Q8N283 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ANKRD35Q8N283 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ANKRD35Q8N283 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ANKRD35Q8N283 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ANKRD35Q8N283 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
ANKRD35Q8N283 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ANKRD35Q8N283 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ANKRD35Q8N283 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ANKRD35Q8N283 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ANKRD35Q8N283 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ANKRD35Q8N283 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
ANKRD35Q8N283 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ANKRD35Q8N283 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ANKRD35Q8N283 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
ANKRD35Q8N283 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ANKRD35Q8N283 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ANKRD35Q8N283 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ANKRD35Q8N283 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ANKRD35Q8N283 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ANKRD35Q8N283 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ANKRD35Q8N283 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ANKRD35Q8N283 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ANKRD35Q8N283 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ANKRD35Q8N283 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ANKRD35Q8N283 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ANKRD35Q8N283 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ANKRD35Q8N283 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ANKRD35Q8N283 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ANKRD35Q8N283 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ANKRD35Q8N283 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ANKRD35Q8N283 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ANKRD35Q8N283 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ANKRD35Q8N283 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ANKRD35Q8N283 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
ANKRD35Q8N283 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ANKRD35Q8N283 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ANKRD35Q8N283 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ANKRD35Q8N283 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ANKRD35Q8N283 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ANKRD35Q8N283 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
ANKRD35Q8N283 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ANKRD35Q8N283 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ANKRD35Q8N283 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ANKRD35Q8N283 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ANKRD35Q8N283 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ANKRD35Q8N283 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ANKRD35Q8N283 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ANKRD35Q8N283 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ANKRD35Q8N283 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ANKRD35Q8N283 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ANKRD35Q8N283 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
ANKRD35Q8N283 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ANKRD35Q8N283 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ANKRD35Q8N283 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ANKRD35Q8N283 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ANKRD35Q8N283 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ANKRD35Q8N283 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ANKRD35Q8N283 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ANKRD35Q8N283 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
ANKRD35Q8N283 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ANKRD35Q8N283 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ANKRD35Q8N283 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ANKRD35Q8N283 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ANKRD35Q8N283 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ANKRD35Q8N283 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ANKRD35Q8N283 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ANKRD35Q8N283 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ANKRD35Q8N283 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ANKRD35Q8N283 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ANKRD35Q8N283 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ANKRD35Q8N283 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ANKRD35Q8N283 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ANKRD35Q8N283 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ANKRD35Q8N283 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ANKRD35Q8N283 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ANKRD35Q8N283 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ANKRD35Q8N283 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ANKRD35Q8N283 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ANKRD35Q8N283 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ANKRD35Q8N283 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
ANKRD35Q8N283 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
ANKRD35Q8N283 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ANKRD35Q8N283 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
ANKRD35Q8N283 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
ANKRD35Q8N283 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
ANKRD35Q8N283 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ANKRD35Q8N283 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ANKRD35Q8N283 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ANKRD35Q8N283 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms