Protein–RNA interactions for Protein: Q8N205

SYNE4, Nesprin-4, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE4Q8N205 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYNE4Q8N205 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYNE4Q8N205 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYNE4Q8N205 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYNE4Q8N205 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYNE4Q8N205 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYNE4Q8N205 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYNE4Q8N205 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYNE4Q8N205 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYNE4Q8N205 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYNE4Q8N205 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYNE4Q8N205 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYNE4Q8N205 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYNE4Q8N205 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYNE4Q8N205 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYNE4Q8N205 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SYNE4Q8N205 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYNE4Q8N205 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYNE4Q8N205 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYNE4Q8N205 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYNE4Q8N205 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYNE4Q8N205 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SYNE4Q8N205 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SYNE4Q8N205 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYNE4Q8N205 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SYNE4Q8N205 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYNE4Q8N205 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYNE4Q8N205 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYNE4Q8N205 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYNE4Q8N205 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYNE4Q8N205 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYNE4Q8N205 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYNE4Q8N205 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYNE4Q8N205 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYNE4Q8N205 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYNE4Q8N205 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYNE4Q8N205 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYNE4Q8N205 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYNE4Q8N205 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYNE4Q8N205 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYNE4Q8N205 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYNE4Q8N205 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYNE4Q8N205 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SYNE4Q8N205 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYNE4Q8N205 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYNE4Q8N205 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYNE4Q8N205 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYNE4Q8N205 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYNE4Q8N205 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SYNE4Q8N205 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYNE4Q8N205 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYNE4Q8N205 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYNE4Q8N205 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYNE4Q8N205 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYNE4Q8N205 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYNE4Q8N205 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYNE4Q8N205 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYNE4Q8N205 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYNE4Q8N205 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYNE4Q8N205 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYNE4Q8N205 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYNE4Q8N205 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYNE4Q8N205 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYNE4Q8N205 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYNE4Q8N205 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYNE4Q8N205 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYNE4Q8N205 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYNE4Q8N205 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SYNE4Q8N205 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYNE4Q8N205 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYNE4Q8N205 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYNE4Q8N205 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYNE4Q8N205 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYNE4Q8N205 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYNE4Q8N205 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYNE4Q8N205 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYNE4Q8N205 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYNE4Q8N205 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SYNE4Q8N205 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYNE4Q8N205 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYNE4Q8N205 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYNE4Q8N205 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYNE4Q8N205 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYNE4Q8N205 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYNE4Q8N205 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYNE4Q8N205 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYNE4Q8N205 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYNE4Q8N205 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYNE4Q8N205 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYNE4Q8N205 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYNE4Q8N205 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYNE4Q8N205 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SYNE4Q8N205 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYNE4Q8N205 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYNE4Q8N205 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYNE4Q8N205 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYNE4Q8N205 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYNE4Q8N205 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYNE4Q8N205 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYNE4Q8N205 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms