Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXI2

RHOT1, Mitochondrial Rho GTPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 618 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOT1Q8IXI2 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RHOT1Q8IXI2 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RHOT1Q8IXI2 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RHOT1Q8IXI2 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RHOT1Q8IXI2 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RHOT1Q8IXI2 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RHOT1Q8IXI2 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RHOT1Q8IXI2 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RHOT1Q8IXI2 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RHOT1Q8IXI2 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RHOT1Q8IXI2 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RHOT1Q8IXI2 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RHOT1Q8IXI2 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RHOT1Q8IXI2 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RHOT1Q8IXI2 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RHOT1Q8IXI2 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RHOT1Q8IXI2 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RHOT1Q8IXI2 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
RHOT1Q8IXI2 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RHOT1Q8IXI2 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RHOT1Q8IXI2 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RHOT1Q8IXI2 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RHOT1Q8IXI2 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RHOT1Q8IXI2 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RHOT1Q8IXI2 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RHOT1Q8IXI2 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RHOT1Q8IXI2 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RHOT1Q8IXI2 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RHOT1Q8IXI2 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RHOT1Q8IXI2 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RHOT1Q8IXI2 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RHOT1Q8IXI2 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RHOT1Q8IXI2 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
RHOT1Q8IXI2 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RHOT1Q8IXI2 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RHOT1Q8IXI2 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RHOT1Q8IXI2 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RHOT1Q8IXI2 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RHOT1Q8IXI2 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RHOT1Q8IXI2 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RHOT1Q8IXI2 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RHOT1Q8IXI2 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RHOT1Q8IXI2 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RHOT1Q8IXI2 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
RHOT1Q8IXI2 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RHOT1Q8IXI2 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RHOT1Q8IXI2 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RHOT1Q8IXI2 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RHOT1Q8IXI2 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RHOT1Q8IXI2 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RHOT1Q8IXI2 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RHOT1Q8IXI2 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RHOT1Q8IXI2 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RHOT1Q8IXI2 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RHOT1Q8IXI2 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RHOT1Q8IXI2 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RHOT1Q8IXI2 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RHOT1Q8IXI2 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RHOT1Q8IXI2 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RHOT1Q8IXI2 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RHOT1Q8IXI2 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RHOT1Q8IXI2 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RHOT1Q8IXI2 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RHOT1Q8IXI2 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RHOT1Q8IXI2 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RHOT1Q8IXI2 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RHOT1Q8IXI2 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RHOT1Q8IXI2 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RHOT1Q8IXI2 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RHOT1Q8IXI2 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RHOT1Q8IXI2 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RHOT1Q8IXI2 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RHOT1Q8IXI2 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RHOT1Q8IXI2 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RHOT1Q8IXI2 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RHOT1Q8IXI2 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RHOT1Q8IXI2 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RHOT1Q8IXI2 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RHOT1Q8IXI2 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RHOT1Q8IXI2 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RHOT1Q8IXI2 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
RHOT1Q8IXI2 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RHOT1Q8IXI2 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RHOT1Q8IXI2 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RHOT1Q8IXI2 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RHOT1Q8IXI2 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RHOT1Q8IXI2 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RHOT1Q8IXI2 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RHOT1Q8IXI2 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RHOT1Q8IXI2 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RHOT1Q8IXI2 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RHOT1Q8IXI2 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RHOT1Q8IXI2 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RHOT1Q8IXI2 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RHOT1Q8IXI2 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RHOT1Q8IXI2 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RHOT1Q8IXI2 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RHOT1Q8IXI2 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RHOT1Q8IXI2 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RHOT1Q8IXI2 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms