Protein–RNA interactions for Protein: Q86YS3

RAB11FIP4, Rab11 family-interacting protein 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP4Q86YS3 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB11FIP4Q86YS3 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB11FIP4Q86YS3 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB11FIP4Q86YS3 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB11FIP4Q86YS3 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB11FIP4Q86YS3 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB11FIP4Q86YS3 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB11FIP4Q86YS3 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB11FIP4Q86YS3 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB11FIP4Q86YS3 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB11FIP4Q86YS3 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB11FIP4Q86YS3 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB11FIP4Q86YS3 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB11FIP4Q86YS3 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB11FIP4Q86YS3 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB11FIP4Q86YS3 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB11FIP4Q86YS3 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB11FIP4Q86YS3 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB11FIP4Q86YS3 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB11FIP4Q86YS3 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB11FIP4Q86YS3 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAB11FIP4Q86YS3 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAB11FIP4Q86YS3 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAB11FIP4Q86YS3 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAB11FIP4Q86YS3 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAB11FIP4Q86YS3 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAB11FIP4Q86YS3 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAB11FIP4Q86YS3 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAB11FIP4Q86YS3 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAB11FIP4Q86YS3 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAB11FIP4Q86YS3 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAB11FIP4Q86YS3 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
RAB11FIP4Q86YS3 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAB11FIP4Q86YS3 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAB11FIP4Q86YS3 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAB11FIP4Q86YS3 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAB11FIP4Q86YS3 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAB11FIP4Q86YS3 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAB11FIP4Q86YS3 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAB11FIP4Q86YS3 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAB11FIP4Q86YS3 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAB11FIP4Q86YS3 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAB11FIP4Q86YS3 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAB11FIP4Q86YS3 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAB11FIP4Q86YS3 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
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RAB11FIP4Q86YS3 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RAB11FIP4Q86YS3 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RAB11FIP4Q86YS3 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RAB11FIP4Q86YS3 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
RAB11FIP4Q86YS3 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RAB11FIP4Q86YS3 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RAB11FIP4Q86YS3 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
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RAB11FIP4Q86YS3 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RAB11FIP4Q86YS3 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RAB11FIP4Q86YS3 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RAB11FIP4Q86YS3 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
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RAB11FIP4Q86YS3 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RAB11FIP4Q86YS3 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
RAB11FIP4Q86YS3 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
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RAB11FIP4Q86YS3 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RAB11FIP4Q86YS3 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RAB11FIP4Q86YS3 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RAB11FIP4Q86YS3 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RAB11FIP4Q86YS3 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RAB11FIP4Q86YS3 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RAB11FIP4Q86YS3 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RAB11FIP4Q86YS3 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RAB11FIP4Q86YS3 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
RAB11FIP4Q86YS3 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
RAB11FIP4Q86YS3 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RAB11FIP4Q86YS3 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RAB11FIP4Q86YS3 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RAB11FIP4Q86YS3 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
RAB11FIP4Q86YS3 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RAB11FIP4Q86YS3 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RAB11FIP4Q86YS3 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RAB11FIP4Q86YS3 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
RAB11FIP4Q86YS3 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RAB11FIP4Q86YS3 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RAB11FIP4Q86YS3 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RAB11FIP4Q86YS3 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB11FIP4Q86YS3 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB11FIP4Q86YS3 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB11FIP4Q86YS3 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB11FIP4Q86YS3 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
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