Protein–RNA interactions for Protein: Q86UE6

LRRTM1, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 1, humanhuman

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Length 522 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM1Q86UE6 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRRTM1Q86UE6 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRRTM1Q86UE6 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRRTM1Q86UE6 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRRTM1Q86UE6 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRRTM1Q86UE6 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRRTM1Q86UE6 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRRTM1Q86UE6 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRRTM1Q86UE6 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRRTM1Q86UE6 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRRTM1Q86UE6 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
LRRTM1Q86UE6 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRRTM1Q86UE6 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
LRRTM1Q86UE6 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
LRRTM1Q86UE6 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
LRRTM1Q86UE6 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRRTM1Q86UE6 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRRTM1Q86UE6 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRRTM1Q86UE6 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
LRRTM1Q86UE6 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRRTM1Q86UE6 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRRTM1Q86UE6 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRRTM1Q86UE6 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRRTM1Q86UE6 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRRTM1Q86UE6 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRRTM1Q86UE6 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRRTM1Q86UE6 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
LRRTM1Q86UE6 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRRTM1Q86UE6 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRRTM1Q86UE6 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRTM1Q86UE6 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRTM1Q86UE6 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRTM1Q86UE6 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRTM1Q86UE6 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRTM1Q86UE6 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRTM1Q86UE6 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRTM1Q86UE6 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRTM1Q86UE6 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRTM1Q86UE6 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRTM1Q86UE6 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRTM1Q86UE6 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRTM1Q86UE6 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRTM1Q86UE6 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRTM1Q86UE6 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRTM1Q86UE6 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRTM1Q86UE6 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRTM1Q86UE6 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRTM1Q86UE6 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRTM1Q86UE6 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRTM1Q86UE6 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRTM1Q86UE6 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRTM1Q86UE6 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRTM1Q86UE6 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRTM1Q86UE6 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRTM1Q86UE6 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRTM1Q86UE6 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRTM1Q86UE6 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRTM1Q86UE6 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRTM1Q86UE6 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRTM1Q86UE6 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRTM1Q86UE6 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRTM1Q86UE6 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRTM1Q86UE6 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRTM1Q86UE6 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRTM1Q86UE6 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRTM1Q86UE6 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRTM1Q86UE6 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRTM1Q86UE6 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRTM1Q86UE6 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRTM1Q86UE6 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRTM1Q86UE6 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRTM1Q86UE6 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRTM1Q86UE6 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRTM1Q86UE6 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRTM1Q86UE6 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRTM1Q86UE6 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRTM1Q86UE6 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRTM1Q86UE6 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRTM1Q86UE6 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRTM1Q86UE6 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRTM1Q86UE6 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRTM1Q86UE6 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRTM1Q86UE6 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRTM1Q86UE6 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRTM1Q86UE6 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRTM1Q86UE6 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRTM1Q86UE6 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRTM1Q86UE6 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRTM1Q86UE6 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRTM1Q86UE6 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRTM1Q86UE6 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRTM1Q86UE6 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRTM1Q86UE6 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRTM1Q86UE6 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRTM1Q86UE6 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRTM1Q86UE6 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRTM1Q86UE6 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRTM1Q86UE6 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRTM1Q86UE6 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRTM1Q86UE6 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78 ms