Protein–RNA interactions for Protein: Q86SZ2

TRAPPC6B, Trafficking protein particle complex subunit 6B, humanhuman

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC6BQ86SZ2 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TRAPPC6BQ86SZ2 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRAPPC6BQ86SZ2 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRAPPC6BQ86SZ2 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRAPPC6BQ86SZ2 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRAPPC6BQ86SZ2 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRAPPC6BQ86SZ2 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRAPPC6BQ86SZ2 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRAPPC6BQ86SZ2 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TRAPPC6BQ86SZ2 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRAPPC6BQ86SZ2 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRAPPC6BQ86SZ2 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRAPPC6BQ86SZ2 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRAPPC6BQ86SZ2 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRAPPC6BQ86SZ2 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TRAPPC6BQ86SZ2 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRAPPC6BQ86SZ2 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRAPPC6BQ86SZ2 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TRAPPC6BQ86SZ2 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TRAPPC6BQ86SZ2 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TRAPPC6BQ86SZ2 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRAPPC6BQ86SZ2 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRAPPC6BQ86SZ2 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRAPPC6BQ86SZ2 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TRAPPC6BQ86SZ2 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRAPPC6BQ86SZ2 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRAPPC6BQ86SZ2 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRAPPC6BQ86SZ2 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRAPPC6BQ86SZ2 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRAPPC6BQ86SZ2 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRAPPC6BQ86SZ2 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRAPPC6BQ86SZ2 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRAPPC6BQ86SZ2 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRAPPC6BQ86SZ2 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRAPPC6BQ86SZ2 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRAPPC6BQ86SZ2 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRAPPC6BQ86SZ2 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TRAPPC6BQ86SZ2 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRAPPC6BQ86SZ2 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRAPPC6BQ86SZ2 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRAPPC6BQ86SZ2 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRAPPC6BQ86SZ2 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRAPPC6BQ86SZ2 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRAPPC6BQ86SZ2 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRAPPC6BQ86SZ2 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRAPPC6BQ86SZ2 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRAPPC6BQ86SZ2 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
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TRAPPC6BQ86SZ2 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRAPPC6BQ86SZ2 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRAPPC6BQ86SZ2 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRAPPC6BQ86SZ2 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRAPPC6BQ86SZ2 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRAPPC6BQ86SZ2 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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TRAPPC6BQ86SZ2 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRAPPC6BQ86SZ2 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRAPPC6BQ86SZ2 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRAPPC6BQ86SZ2 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRAPPC6BQ86SZ2 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAPPC6BQ86SZ2 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAPPC6BQ86SZ2 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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TRAPPC6BQ86SZ2 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAPPC6BQ86SZ2 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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TRAPPC6BQ86SZ2 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAPPC6BQ86SZ2 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAPPC6BQ86SZ2 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAPPC6BQ86SZ2 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAPPC6BQ86SZ2 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAPPC6BQ86SZ2 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAPPC6BQ86SZ2 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAPPC6BQ86SZ2 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAPPC6BQ86SZ2 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAPPC6BQ86SZ2 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAPPC6BQ86SZ2 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAPPC6BQ86SZ2 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAPPC6BQ86SZ2 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAPPC6BQ86SZ2 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAPPC6BQ86SZ2 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAPPC6BQ86SZ2 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAPPC6BQ86SZ2 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAPPC6BQ86SZ2 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAPPC6BQ86SZ2 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAPPC6BQ86SZ2 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAPPC6BQ86SZ2 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAPPC6BQ86SZ2 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAPPC6BQ86SZ2 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAPPC6BQ86SZ2 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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