Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Q1

SLC46A3, Solute carrier family 46 member 3, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC46A3Q7Z3Q1 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC46A3Q7Z3Q1 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC46A3Q7Z3Q1 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC46A3Q7Z3Q1 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC46A3Q7Z3Q1 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC46A3Q7Z3Q1 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SLC46A3Q7Z3Q1 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SLC46A3Q7Z3Q1 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SLC46A3Q7Z3Q1 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SLC46A3Q7Z3Q1 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SLC46A3Q7Z3Q1 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SLC46A3Q7Z3Q1 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SLC46A3Q7Z3Q1 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SLC46A3Q7Z3Q1 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
SLC46A3Q7Z3Q1 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SLC46A3Q7Z3Q1 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SLC46A3Q7Z3Q1 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SLC46A3Q7Z3Q1 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SLC46A3Q7Z3Q1 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SLC46A3Q7Z3Q1 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SLC46A3Q7Z3Q1 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
SLC46A3Q7Z3Q1 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SLC46A3Q7Z3Q1 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SLC46A3Q7Z3Q1 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SLC46A3Q7Z3Q1 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SLC46A3Q7Z3Q1 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SLC46A3Q7Z3Q1 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SLC46A3Q7Z3Q1 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SLC46A3Q7Z3Q1 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SLC46A3Q7Z3Q1 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SLC46A3Q7Z3Q1 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SLC46A3Q7Z3Q1 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SLC46A3Q7Z3Q1 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SLC46A3Q7Z3Q1 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SLC46A3Q7Z3Q1 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SLC46A3Q7Z3Q1 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SLC46A3Q7Z3Q1 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SLC46A3Q7Z3Q1 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SLC46A3Q7Z3Q1 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SLC46A3Q7Z3Q1 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SLC46A3Q7Z3Q1 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SLC46A3Q7Z3Q1 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SLC46A3Q7Z3Q1 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SLC46A3Q7Z3Q1 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
SLC46A3Q7Z3Q1 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SLC46A3Q7Z3Q1 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SLC46A3Q7Z3Q1 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SLC46A3Q7Z3Q1 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
SLC46A3Q7Z3Q1 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SLC46A3Q7Z3Q1 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SLC46A3Q7Z3Q1 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SLC46A3Q7Z3Q1 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SLC46A3Q7Z3Q1 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SLC46A3Q7Z3Q1 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SLC46A3Q7Z3Q1 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SLC46A3Q7Z3Q1 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SLC46A3Q7Z3Q1 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SLC46A3Q7Z3Q1 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SLC46A3Q7Z3Q1 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SLC46A3Q7Z3Q1 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SLC46A3Q7Z3Q1 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SLC46A3Q7Z3Q1 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SLC46A3Q7Z3Q1 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SLC46A3Q7Z3Q1 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SLC46A3Q7Z3Q1 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SLC46A3Q7Z3Q1 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SLC46A3Q7Z3Q1 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SLC46A3Q7Z3Q1 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SLC46A3Q7Z3Q1 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SLC46A3Q7Z3Q1 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
SLC46A3Q7Z3Q1 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SLC46A3Q7Z3Q1 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SLC46A3Q7Z3Q1 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SLC46A3Q7Z3Q1 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SLC46A3Q7Z3Q1 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SLC46A3Q7Z3Q1 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SLC46A3Q7Z3Q1 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SLC46A3Q7Z3Q1 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
SLC46A3Q7Z3Q1 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SLC46A3Q7Z3Q1 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SLC46A3Q7Z3Q1 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SLC46A3Q7Z3Q1 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
SLC46A3Q7Z3Q1 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
SLC46A3Q7Z3Q1 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SLC46A3Q7Z3Q1 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SLC46A3Q7Z3Q1 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SLC46A3Q7Z3Q1 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SLC46A3Q7Z3Q1 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SLC46A3Q7Z3Q1 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SLC46A3Q7Z3Q1 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SLC46A3Q7Z3Q1 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SLC46A3Q7Z3Q1 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SLC46A3Q7Z3Q1 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SLC46A3Q7Z3Q1 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SLC46A3Q7Z3Q1 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SLC46A3Q7Z3Q1 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SLC46A3Q7Z3Q1 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SLC46A3Q7Z3Q1 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SLC46A3Q7Z3Q1 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SLC46A3Q7Z3Q1 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
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