Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3B4

NUP54, Nucleoporin p54, humanhuman

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP54Q7Z3B4 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NUP54Q7Z3B4 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NUP54Q7Z3B4 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NUP54Q7Z3B4 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NUP54Q7Z3B4 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NUP54Q7Z3B4 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NUP54Q7Z3B4 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NUP54Q7Z3B4 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NUP54Q7Z3B4 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NUP54Q7Z3B4 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NUP54Q7Z3B4 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NUP54Q7Z3B4 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NUP54Q7Z3B4 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NUP54Q7Z3B4 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NUP54Q7Z3B4 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NUP54Q7Z3B4 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NUP54Q7Z3B4 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NUP54Q7Z3B4 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NUP54Q7Z3B4 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NUP54Q7Z3B4 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NUP54Q7Z3B4 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NUP54Q7Z3B4 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NUP54Q7Z3B4 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NUP54Q7Z3B4 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NUP54Q7Z3B4 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NUP54Q7Z3B4 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NUP54Q7Z3B4 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NUP54Q7Z3B4 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NUP54Q7Z3B4 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NUP54Q7Z3B4 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NUP54Q7Z3B4 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NUP54Q7Z3B4 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NUP54Q7Z3B4 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
NUP54Q7Z3B4 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NUP54Q7Z3B4 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NUP54Q7Z3B4 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
NUP54Q7Z3B4 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NUP54Q7Z3B4 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
NUP54Q7Z3B4 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NUP54Q7Z3B4 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NUP54Q7Z3B4 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NUP54Q7Z3B4 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NUP54Q7Z3B4 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NUP54Q7Z3B4 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NUP54Q7Z3B4 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NUP54Q7Z3B4 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NUP54Q7Z3B4 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NUP54Q7Z3B4 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NUP54Q7Z3B4 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NUP54Q7Z3B4 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NUP54Q7Z3B4 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NUP54Q7Z3B4 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NUP54Q7Z3B4 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NUP54Q7Z3B4 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NUP54Q7Z3B4 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NUP54Q7Z3B4 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NUP54Q7Z3B4 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NUP54Q7Z3B4 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NUP54Q7Z3B4 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NUP54Q7Z3B4 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NUP54Q7Z3B4 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NUP54Q7Z3B4 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NUP54Q7Z3B4 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NUP54Q7Z3B4 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NUP54Q7Z3B4 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NUP54Q7Z3B4 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NUP54Q7Z3B4 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NUP54Q7Z3B4 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NUP54Q7Z3B4 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NUP54Q7Z3B4 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NUP54Q7Z3B4 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NUP54Q7Z3B4 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NUP54Q7Z3B4 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NUP54Q7Z3B4 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NUP54Q7Z3B4 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NUP54Q7Z3B4 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NUP54Q7Z3B4 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NUP54Q7Z3B4 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NUP54Q7Z3B4 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NUP54Q7Z3B4 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NUP54Q7Z3B4 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NUP54Q7Z3B4 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NUP54Q7Z3B4 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NUP54Q7Z3B4 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NUP54Q7Z3B4 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NUP54Q7Z3B4 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NUP54Q7Z3B4 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NUP54Q7Z3B4 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NUP54Q7Z3B4 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NUP54Q7Z3B4 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NUP54Q7Z3B4 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NUP54Q7Z3B4 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NUP54Q7Z3B4 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NUP54Q7Z3B4 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NUP54Q7Z3B4 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NUP54Q7Z3B4 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NUP54Q7Z3B4 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NUP54Q7Z3B4 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
NUP54Q7Z3B4 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
NUP54Q7Z3B4 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms