Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTM1

OTOP1, Otopetrin-1, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTOP1Q7RTM1 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
OTOP1Q7RTM1 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
OTOP1Q7RTM1 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
OTOP1Q7RTM1 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
OTOP1Q7RTM1 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
OTOP1Q7RTM1 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
OTOP1Q7RTM1 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
OTOP1Q7RTM1 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
OTOP1Q7RTM1 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
OTOP1Q7RTM1 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
OTOP1Q7RTM1 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
OTOP1Q7RTM1 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
OTOP1Q7RTM1 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
OTOP1Q7RTM1 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
OTOP1Q7RTM1 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
OTOP1Q7RTM1 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
OTOP1Q7RTM1 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
OTOP1Q7RTM1 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
OTOP1Q7RTM1 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
OTOP1Q7RTM1 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
OTOP1Q7RTM1 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
OTOP1Q7RTM1 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
OTOP1Q7RTM1 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
OTOP1Q7RTM1 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
OTOP1Q7RTM1 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
OTOP1Q7RTM1 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
OTOP1Q7RTM1 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
OTOP1Q7RTM1 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
OTOP1Q7RTM1 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
OTOP1Q7RTM1 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
OTOP1Q7RTM1 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
OTOP1Q7RTM1 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
OTOP1Q7RTM1 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
OTOP1Q7RTM1 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
OTOP1Q7RTM1 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
OTOP1Q7RTM1 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
OTOP1Q7RTM1 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
OTOP1Q7RTM1 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
OTOP1Q7RTM1 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
OTOP1Q7RTM1 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
OTOP1Q7RTM1 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
OTOP1Q7RTM1 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
OTOP1Q7RTM1 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
OTOP1Q7RTM1 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
OTOP1Q7RTM1 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
OTOP1Q7RTM1 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
OTOP1Q7RTM1 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
OTOP1Q7RTM1 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
OTOP1Q7RTM1 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
OTOP1Q7RTM1 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
OTOP1Q7RTM1 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
OTOP1Q7RTM1 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
OTOP1Q7RTM1 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
OTOP1Q7RTM1 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
OTOP1Q7RTM1 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
OTOP1Q7RTM1 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
OTOP1Q7RTM1 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
OTOP1Q7RTM1 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
OTOP1Q7RTM1 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
OTOP1Q7RTM1 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
OTOP1Q7RTM1 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
OTOP1Q7RTM1 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
OTOP1Q7RTM1 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
OTOP1Q7RTM1 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
OTOP1Q7RTM1 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
OTOP1Q7RTM1 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
OTOP1Q7RTM1 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
OTOP1Q7RTM1 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
OTOP1Q7RTM1 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
OTOP1Q7RTM1 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
OTOP1Q7RTM1 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
OTOP1Q7RTM1 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
OTOP1Q7RTM1 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
OTOP1Q7RTM1 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
OTOP1Q7RTM1 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
OTOP1Q7RTM1 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
OTOP1Q7RTM1 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
OTOP1Q7RTM1 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
OTOP1Q7RTM1 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
OTOP1Q7RTM1 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
OTOP1Q7RTM1 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
OTOP1Q7RTM1 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
OTOP1Q7RTM1 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
OTOP1Q7RTM1 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
OTOP1Q7RTM1 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
OTOP1Q7RTM1 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
OTOP1Q7RTM1 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
OTOP1Q7RTM1 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
OTOP1Q7RTM1 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
OTOP1Q7RTM1 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
OTOP1Q7RTM1 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
OTOP1Q7RTM1 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
OTOP1Q7RTM1 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
OTOP1Q7RTM1 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
OTOP1Q7RTM1 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
OTOP1Q7RTM1 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
OTOP1Q7RTM1 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
OTOP1Q7RTM1 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
OTOP1Q7RTM1 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
OTOP1Q7RTM1 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms