Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL3

USP50, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 50, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP50Q70EL3 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP50Q70EL3 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP50Q70EL3 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
USP50Q70EL3 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP50Q70EL3 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP50Q70EL3 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP50Q70EL3 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP50Q70EL3 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP50Q70EL3 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP50Q70EL3 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP50Q70EL3 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP50Q70EL3 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
USP50Q70EL3 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
USP50Q70EL3 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP50Q70EL3 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
USP50Q70EL3 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP50Q70EL3 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP50Q70EL3 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP50Q70EL3 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP50Q70EL3 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP50Q70EL3 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP50Q70EL3 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP50Q70EL3 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP50Q70EL3 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP50Q70EL3 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP50Q70EL3 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP50Q70EL3 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP50Q70EL3 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP50Q70EL3 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP50Q70EL3 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
USP50Q70EL3 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP50Q70EL3 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP50Q70EL3 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP50Q70EL3 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP50Q70EL3 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP50Q70EL3 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP50Q70EL3 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP50Q70EL3 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
USP50Q70EL3 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP50Q70EL3 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP50Q70EL3 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP50Q70EL3 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP50Q70EL3 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP50Q70EL3 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP50Q70EL3 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP50Q70EL3 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP50Q70EL3 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP50Q70EL3 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
USP50Q70EL3 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP50Q70EL3 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP50Q70EL3 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP50Q70EL3 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP50Q70EL3 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP50Q70EL3 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP50Q70EL3 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP50Q70EL3 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP50Q70EL3 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP50Q70EL3 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP50Q70EL3 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP50Q70EL3 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP50Q70EL3 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP50Q70EL3 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP50Q70EL3 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP50Q70EL3 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP50Q70EL3 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP50Q70EL3 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP50Q70EL3 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP50Q70EL3 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
USP50Q70EL3 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP50Q70EL3 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP50Q70EL3 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
USP50Q70EL3 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
USP50Q70EL3 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
USP50Q70EL3 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP50Q70EL3 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP50Q70EL3 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP50Q70EL3 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP50Q70EL3 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP50Q70EL3 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
USP50Q70EL3 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
USP50Q70EL3 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP50Q70EL3 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP50Q70EL3 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP50Q70EL3 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP50Q70EL3 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP50Q70EL3 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP50Q70EL3 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP50Q70EL3 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP50Q70EL3 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP50Q70EL3 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP50Q70EL3 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
USP50Q70EL3 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
USP50Q70EL3 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP50Q70EL3 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP50Q70EL3 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP50Q70EL3 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP50Q70EL3 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP50Q70EL3 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP50Q70EL3 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP50Q70EL3 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
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