Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWD8

C16orf54, Transmembrane protein C16orf54, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf54Q6UWD8 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC14.2□□□□□ -0.14
C16orf54Q6UWD8 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
C16orf54Q6UWD8 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
C16orf54Q6UWD8 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
C16orf54Q6UWD8 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
C16orf54Q6UWD8 ZBP1-201ENST00000371173 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
C16orf54Q6UWD8 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
C16orf54Q6UWD8 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
C16orf54Q6UWD8 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
C16orf54Q6UWD8 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
C16orf54Q6UWD8 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
C16orf54Q6UWD8 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
C16orf54Q6UWD8 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
C16orf54Q6UWD8 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
C16orf54Q6UWD8 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
C16orf54Q6UWD8 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
C16orf54Q6UWD8 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
C16orf54Q6UWD8 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
C16orf54Q6UWD8 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
C16orf54Q6UWD8 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
C16orf54Q6UWD8 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
C16orf54Q6UWD8 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
C16orf54Q6UWD8 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
C16orf54Q6UWD8 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
C16orf54Q6UWD8 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
C16orf54Q6UWD8 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
C16orf54Q6UWD8 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
C16orf54Q6UWD8 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
C16orf54Q6UWD8 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
C16orf54Q6UWD8 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
C16orf54Q6UWD8 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
C16orf54Q6UWD8 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
C16orf54Q6UWD8 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
C16orf54Q6UWD8 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
C16orf54Q6UWD8 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
C16orf54Q6UWD8 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
C16orf54Q6UWD8 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
C16orf54Q6UWD8 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
C16orf54Q6UWD8 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
C16orf54Q6UWD8 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
C16orf54Q6UWD8 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
C16orf54Q6UWD8 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
C16orf54Q6UWD8 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
C16orf54Q6UWD8 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
C16orf54Q6UWD8 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
C16orf54Q6UWD8 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
C16orf54Q6UWD8 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
C16orf54Q6UWD8 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
C16orf54Q6UWD8 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
C16orf54Q6UWD8 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
C16orf54Q6UWD8 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
C16orf54Q6UWD8 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
C16orf54Q6UWD8 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
C16orf54Q6UWD8 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
C16orf54Q6UWD8 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
C16orf54Q6UWD8 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
C16orf54Q6UWD8 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
C16orf54Q6UWD8 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
C16orf54Q6UWD8 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
C16orf54Q6UWD8 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.18□□□□□ -0.14
C16orf54Q6UWD8 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
C16orf54Q6UWD8 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
C16orf54Q6UWD8 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
C16orf54Q6UWD8 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
C16orf54Q6UWD8 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
C16orf54Q6UWD8 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
C16orf54Q6UWD8 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
C16orf54Q6UWD8 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC14.18□□□□□ -0.14
C16orf54Q6UWD8 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
C16orf54Q6UWD8 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC14.18□□□□□ -0.14
C16orf54Q6UWD8 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.18□□□□□ -0.14
C16orf54Q6UWD8 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
C16orf54Q6UWD8 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
C16orf54Q6UWD8 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
C16orf54Q6UWD8 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
C16orf54Q6UWD8 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
C16orf54Q6UWD8 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
C16orf54Q6UWD8 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
C16orf54Q6UWD8 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
C16orf54Q6UWD8 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
C16orf54Q6UWD8 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
C16orf54Q6UWD8 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
C16orf54Q6UWD8 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
C16orf54Q6UWD8 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
C16orf54Q6UWD8 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
C16orf54Q6UWD8 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
C16orf54Q6UWD8 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
C16orf54Q6UWD8 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
C16orf54Q6UWD8 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
C16orf54Q6UWD8 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
C16orf54Q6UWD8 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
C16orf54Q6UWD8 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
C16orf54Q6UWD8 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
C16orf54Q6UWD8 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
C16orf54Q6UWD8 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
C16orf54Q6UWD8 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
C16orf54Q6UWD8 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
C16orf54Q6UWD8 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
C16orf54Q6UWD8 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
C16orf54Q6UWD8 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms