Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2S7

TTC41P, Putative tetratricopeptide repeat protein 41, humanhuman

Predictions only

Length 1,318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC41PQ6P2S7 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TTC41PQ6P2S7 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TTC41PQ6P2S7 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TTC41PQ6P2S7 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TTC41PQ6P2S7 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TTC41PQ6P2S7 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TTC41PQ6P2S7 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TTC41PQ6P2S7 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TTC41PQ6P2S7 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TTC41PQ6P2S7 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TTC41PQ6P2S7 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TTC41PQ6P2S7 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TTC41PQ6P2S7 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TTC41PQ6P2S7 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TTC41PQ6P2S7 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TTC41PQ6P2S7 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TTC41PQ6P2S7 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TTC41PQ6P2S7 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TTC41PQ6P2S7 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TTC41PQ6P2S7 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TTC41PQ6P2S7 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TTC41PQ6P2S7 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TTC41PQ6P2S7 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TTC41PQ6P2S7 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TTC41PQ6P2S7 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TTC41PQ6P2S7 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TTC41PQ6P2S7 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TTC41PQ6P2S7 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TTC41PQ6P2S7 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TTC41PQ6P2S7 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TTC41PQ6P2S7 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TTC41PQ6P2S7 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TTC41PQ6P2S7 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TTC41PQ6P2S7 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TTC41PQ6P2S7 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TTC41PQ6P2S7 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TTC41PQ6P2S7 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TTC41PQ6P2S7 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TTC41PQ6P2S7 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TTC41PQ6P2S7 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TTC41PQ6P2S7 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TTC41PQ6P2S7 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TTC41PQ6P2S7 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TTC41PQ6P2S7 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
TTC41PQ6P2S7 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
TTC41PQ6P2S7 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
TTC41PQ6P2S7 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
TTC41PQ6P2S7 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TTC41PQ6P2S7 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TTC41PQ6P2S7 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TTC41PQ6P2S7 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TTC41PQ6P2S7 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TTC41PQ6P2S7 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TTC41PQ6P2S7 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TTC41PQ6P2S7 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TTC41PQ6P2S7 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TTC41PQ6P2S7 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TTC41PQ6P2S7 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TTC41PQ6P2S7 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TTC41PQ6P2S7 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TTC41PQ6P2S7 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TTC41PQ6P2S7 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TTC41PQ6P2S7 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TTC41PQ6P2S7 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TTC41PQ6P2S7 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TTC41PQ6P2S7 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TTC41PQ6P2S7 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TTC41PQ6P2S7 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TTC41PQ6P2S7 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TTC41PQ6P2S7 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TTC41PQ6P2S7 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TTC41PQ6P2S7 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TTC41PQ6P2S7 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TTC41PQ6P2S7 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TTC41PQ6P2S7 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TTC41PQ6P2S7 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TTC41PQ6P2S7 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TTC41PQ6P2S7 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TTC41PQ6P2S7 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TTC41PQ6P2S7 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TTC41PQ6P2S7 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TTC41PQ6P2S7 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TTC41PQ6P2S7 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TTC41PQ6P2S7 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TTC41PQ6P2S7 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TTC41PQ6P2S7 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TTC41PQ6P2S7 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TTC41PQ6P2S7 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TTC41PQ6P2S7 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TTC41PQ6P2S7 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TTC41PQ6P2S7 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TTC41PQ6P2S7 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TTC41PQ6P2S7 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TTC41PQ6P2S7 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TTC41PQ6P2S7 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TTC41PQ6P2S7 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TTC41PQ6P2S7 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TTC41PQ6P2S7 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TTC41PQ6P2S7 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TTC41PQ6P2S7 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms