Protein–RNA interactions for Protein: Q6NT76

HMBOX1, Homeobox-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMBOX1Q6NT76 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HMBOX1Q6NT76 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HMBOX1Q6NT76 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HMBOX1Q6NT76 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HMBOX1Q6NT76 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HMBOX1Q6NT76 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HMBOX1Q6NT76 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HMBOX1Q6NT76 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HMBOX1Q6NT76 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HMBOX1Q6NT76 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HMBOX1Q6NT76 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HMBOX1Q6NT76 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HMBOX1Q6NT76 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HMBOX1Q6NT76 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HMBOX1Q6NT76 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HMBOX1Q6NT76 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HMBOX1Q6NT76 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HMBOX1Q6NT76 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HMBOX1Q6NT76 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HMBOX1Q6NT76 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HMBOX1Q6NT76 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HMBOX1Q6NT76 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
HMBOX1Q6NT76 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HMBOX1Q6NT76 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
HMBOX1Q6NT76 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
HMBOX1Q6NT76 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HMBOX1Q6NT76 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HMBOX1Q6NT76 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HMBOX1Q6NT76 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HMBOX1Q6NT76 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HMBOX1Q6NT76 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HMBOX1Q6NT76 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HMBOX1Q6NT76 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HMBOX1Q6NT76 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HMBOX1Q6NT76 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HMBOX1Q6NT76 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HMBOX1Q6NT76 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
HMBOX1Q6NT76 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HMBOX1Q6NT76 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HMBOX1Q6NT76 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HMBOX1Q6NT76 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HMBOX1Q6NT76 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HMBOX1Q6NT76 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HMBOX1Q6NT76 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HMBOX1Q6NT76 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HMBOX1Q6NT76 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HMBOX1Q6NT76 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HMBOX1Q6NT76 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HMBOX1Q6NT76 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HMBOX1Q6NT76 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HMBOX1Q6NT76 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HMBOX1Q6NT76 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HMBOX1Q6NT76 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HMBOX1Q6NT76 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HMBOX1Q6NT76 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HMBOX1Q6NT76 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HMBOX1Q6NT76 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
HMBOX1Q6NT76 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HMBOX1Q6NT76 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HMBOX1Q6NT76 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HMBOX1Q6NT76 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HMBOX1Q6NT76 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HMBOX1Q6NT76 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HMBOX1Q6NT76 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HMBOX1Q6NT76 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HMBOX1Q6NT76 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HMBOX1Q6NT76 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HMBOX1Q6NT76 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HMBOX1Q6NT76 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
HMBOX1Q6NT76 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HMBOX1Q6NT76 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HMBOX1Q6NT76 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HMBOX1Q6NT76 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
HMBOX1Q6NT76 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HMBOX1Q6NT76 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HMBOX1Q6NT76 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HMBOX1Q6NT76 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HMBOX1Q6NT76 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HMBOX1Q6NT76 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HMBOX1Q6NT76 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HMBOX1Q6NT76 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HMBOX1Q6NT76 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HMBOX1Q6NT76 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HMBOX1Q6NT76 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HMBOX1Q6NT76 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HMBOX1Q6NT76 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
HMBOX1Q6NT76 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HMBOX1Q6NT76 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HMBOX1Q6NT76 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HMBOX1Q6NT76 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HMBOX1Q6NT76 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HMBOX1Q6NT76 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HMBOX1Q6NT76 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HMBOX1Q6NT76 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HMBOX1Q6NT76 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HMBOX1Q6NT76 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HMBOX1Q6NT76 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HMBOX1Q6NT76 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HMBOX1Q6NT76 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
HMBOX1Q6NT76 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms