Protein–RNA interactions for Protein: Q6JVE6

LCN10, Epididymal-specific lipocalin-10, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCN10Q6JVE6 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LCN10Q6JVE6 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LCN10Q6JVE6 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LCN10Q6JVE6 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LCN10Q6JVE6 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LCN10Q6JVE6 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LCN10Q6JVE6 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LCN10Q6JVE6 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LCN10Q6JVE6 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LCN10Q6JVE6 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
LCN10Q6JVE6 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LCN10Q6JVE6 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LCN10Q6JVE6 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LCN10Q6JVE6 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LCN10Q6JVE6 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
LCN10Q6JVE6 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
LCN10Q6JVE6 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LCN10Q6JVE6 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LCN10Q6JVE6 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LCN10Q6JVE6 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LCN10Q6JVE6 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LCN10Q6JVE6 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LCN10Q6JVE6 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LCN10Q6JVE6 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LCN10Q6JVE6 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LCN10Q6JVE6 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LCN10Q6JVE6 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LCN10Q6JVE6 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LCN10Q6JVE6 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LCN10Q6JVE6 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LCN10Q6JVE6 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LCN10Q6JVE6 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LCN10Q6JVE6 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LCN10Q6JVE6 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LCN10Q6JVE6 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LCN10Q6JVE6 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LCN10Q6JVE6 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LCN10Q6JVE6 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LCN10Q6JVE6 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LCN10Q6JVE6 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LCN10Q6JVE6 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LCN10Q6JVE6 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LCN10Q6JVE6 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LCN10Q6JVE6 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
LCN10Q6JVE6 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LCN10Q6JVE6 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LCN10Q6JVE6 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LCN10Q6JVE6 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
LCN10Q6JVE6 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LCN10Q6JVE6 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LCN10Q6JVE6 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LCN10Q6JVE6 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LCN10Q6JVE6 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LCN10Q6JVE6 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LCN10Q6JVE6 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LCN10Q6JVE6 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LCN10Q6JVE6 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LCN10Q6JVE6 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LCN10Q6JVE6 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LCN10Q6JVE6 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
LCN10Q6JVE6 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LCN10Q6JVE6 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LCN10Q6JVE6 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LCN10Q6JVE6 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LCN10Q6JVE6 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LCN10Q6JVE6 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LCN10Q6JVE6 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LCN10Q6JVE6 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LCN10Q6JVE6 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LCN10Q6JVE6 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
LCN10Q6JVE6 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LCN10Q6JVE6 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
LCN10Q6JVE6 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LCN10Q6JVE6 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LCN10Q6JVE6 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
LCN10Q6JVE6 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LCN10Q6JVE6 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
LCN10Q6JVE6 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LCN10Q6JVE6 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LCN10Q6JVE6 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LCN10Q6JVE6 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LCN10Q6JVE6 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LCN10Q6JVE6 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LCN10Q6JVE6 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LCN10Q6JVE6 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LCN10Q6JVE6 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LCN10Q6JVE6 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
LCN10Q6JVE6 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LCN10Q6JVE6 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LCN10Q6JVE6 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LCN10Q6JVE6 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LCN10Q6JVE6 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LCN10Q6JVE6 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LCN10Q6JVE6 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LCN10Q6JVE6 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LCN10Q6JVE6 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LCN10Q6JVE6 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LCN10Q6JVE6 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LCN10Q6JVE6 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LCN10Q6JVE6 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms