Protein–RNA interactions for Protein: Q6IQ49

SDE2, Protein SDE2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDE2Q6IQ49 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SDE2Q6IQ49 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SDE2Q6IQ49 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SDE2Q6IQ49 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SDE2Q6IQ49 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SDE2Q6IQ49 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SDE2Q6IQ49 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SDE2Q6IQ49 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SDE2Q6IQ49 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SDE2Q6IQ49 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SDE2Q6IQ49 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SDE2Q6IQ49 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SDE2Q6IQ49 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SDE2Q6IQ49 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SDE2Q6IQ49 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SDE2Q6IQ49 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SDE2Q6IQ49 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SDE2Q6IQ49 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SDE2Q6IQ49 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SDE2Q6IQ49 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SDE2Q6IQ49 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SDE2Q6IQ49 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SDE2Q6IQ49 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SDE2Q6IQ49 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SDE2Q6IQ49 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SDE2Q6IQ49 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SDE2Q6IQ49 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SDE2Q6IQ49 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SDE2Q6IQ49 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SDE2Q6IQ49 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SDE2Q6IQ49 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SDE2Q6IQ49 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SDE2Q6IQ49 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SDE2Q6IQ49 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SDE2Q6IQ49 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SDE2Q6IQ49 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SDE2Q6IQ49 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SDE2Q6IQ49 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
SDE2Q6IQ49 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SDE2Q6IQ49 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
SDE2Q6IQ49 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SDE2Q6IQ49 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SDE2Q6IQ49 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SDE2Q6IQ49 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SDE2Q6IQ49 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SDE2Q6IQ49 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SDE2Q6IQ49 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SDE2Q6IQ49 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SDE2Q6IQ49 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SDE2Q6IQ49 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
SDE2Q6IQ49 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SDE2Q6IQ49 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SDE2Q6IQ49 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SDE2Q6IQ49 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SDE2Q6IQ49 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SDE2Q6IQ49 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SDE2Q6IQ49 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SDE2Q6IQ49 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SDE2Q6IQ49 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SDE2Q6IQ49 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SDE2Q6IQ49 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SDE2Q6IQ49 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SDE2Q6IQ49 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SDE2Q6IQ49 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SDE2Q6IQ49 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SDE2Q6IQ49 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SDE2Q6IQ49 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SDE2Q6IQ49 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SDE2Q6IQ49 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SDE2Q6IQ49 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SDE2Q6IQ49 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SDE2Q6IQ49 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SDE2Q6IQ49 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SDE2Q6IQ49 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SDE2Q6IQ49 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SDE2Q6IQ49 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SDE2Q6IQ49 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SDE2Q6IQ49 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SDE2Q6IQ49 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SDE2Q6IQ49 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SDE2Q6IQ49 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SDE2Q6IQ49 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SDE2Q6IQ49 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SDE2Q6IQ49 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SDE2Q6IQ49 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SDE2Q6IQ49 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SDE2Q6IQ49 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SDE2Q6IQ49 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SDE2Q6IQ49 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SDE2Q6IQ49 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SDE2Q6IQ49 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SDE2Q6IQ49 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SDE2Q6IQ49 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SDE2Q6IQ49 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SDE2Q6IQ49 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SDE2Q6IQ49 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SDE2Q6IQ49 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SDE2Q6IQ49 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SDE2Q6IQ49 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SDE2Q6IQ49 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms