Protein–RNA interactions for Protein: Q676U5

ATG16L1, Autophagy-related protein 16-1, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L1Q676U5 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATG16L1Q676U5 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATG16L1Q676U5 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATG16L1Q676U5 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATG16L1Q676U5 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATG16L1Q676U5 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATG16L1Q676U5 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATG16L1Q676U5 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATG16L1Q676U5 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATG16L1Q676U5 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATG16L1Q676U5 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATG16L1Q676U5 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATG16L1Q676U5 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATG16L1Q676U5 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATG16L1Q676U5 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATG16L1Q676U5 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATG16L1Q676U5 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATG16L1Q676U5 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATG16L1Q676U5 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATG16L1Q676U5 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATG16L1Q676U5 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATG16L1Q676U5 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATG16L1Q676U5 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATG16L1Q676U5 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATG16L1Q676U5 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATG16L1Q676U5 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATG16L1Q676U5 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ATG16L1Q676U5 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATG16L1Q676U5 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATG16L1Q676U5 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATG16L1Q676U5 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATG16L1Q676U5 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATG16L1Q676U5 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATG16L1Q676U5 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATG16L1Q676U5 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATG16L1Q676U5 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATG16L1Q676U5 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATG16L1Q676U5 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATG16L1Q676U5 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATG16L1Q676U5 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATG16L1Q676U5 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATG16L1Q676U5 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATG16L1Q676U5 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATG16L1Q676U5 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATG16L1Q676U5 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATG16L1Q676U5 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATG16L1Q676U5 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATG16L1Q676U5 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATG16L1Q676U5 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATG16L1Q676U5 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATG16L1Q676U5 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATG16L1Q676U5 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATG16L1Q676U5 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATG16L1Q676U5 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATG16L1Q676U5 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATG16L1Q676U5 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATG16L1Q676U5 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATG16L1Q676U5 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATG16L1Q676U5 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATG16L1Q676U5 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATG16L1Q676U5 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATG16L1Q676U5 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATG16L1Q676U5 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATG16L1Q676U5 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATG16L1Q676U5 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATG16L1Q676U5 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ATG16L1Q676U5 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ATG16L1Q676U5 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATG16L1Q676U5 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATG16L1Q676U5 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATG16L1Q676U5 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATG16L1Q676U5 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATG16L1Q676U5 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATG16L1Q676U5 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATG16L1Q676U5 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATG16L1Q676U5 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATG16L1Q676U5 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATG16L1Q676U5 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATG16L1Q676U5 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATG16L1Q676U5 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATG16L1Q676U5 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATG16L1Q676U5 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATG16L1Q676U5 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATG16L1Q676U5 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATG16L1Q676U5 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATG16L1Q676U5 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATG16L1Q676U5 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATG16L1Q676U5 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATG16L1Q676U5 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATG16L1Q676U5 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATG16L1Q676U5 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATG16L1Q676U5 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATG16L1Q676U5 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATG16L1Q676U5 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATG16L1Q676U5 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATG16L1Q676U5 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATG16L1Q676U5 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATG16L1Q676U5 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATG16L1Q676U5 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATG16L1Q676U5 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms