Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZK9

CARMIL1, F-actin-uncapping protein LRRC16A, humanhuman

Predictions only

Length 1,371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL1Q5VZK9 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CARMIL1Q5VZK9 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CARMIL1Q5VZK9 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
CARMIL1Q5VZK9 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CARMIL1Q5VZK9 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CARMIL1Q5VZK9 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CARMIL1Q5VZK9 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
CARMIL1Q5VZK9 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CARMIL1Q5VZK9 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CARMIL1Q5VZK9 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CARMIL1Q5VZK9 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CARMIL1Q5VZK9 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CARMIL1Q5VZK9 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CARMIL1Q5VZK9 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CARMIL1Q5VZK9 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CARMIL1Q5VZK9 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.33
CARMIL1Q5VZK9 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.33
CARMIL1Q5VZK9 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.33
CARMIL1Q5VZK9 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.33
CARMIL1Q5VZK9 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC29.64■■■□□ 2.33
CARMIL1Q5VZK9 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.33
CARMIL1Q5VZK9 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
CARMIL1Q5VZK9 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CARMIL1Q5VZK9 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CARMIL1Q5VZK9 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CARMIL1Q5VZK9 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CARMIL1Q5VZK9 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CARMIL1Q5VZK9 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CARMIL1Q5VZK9 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CARMIL1Q5VZK9 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CARMIL1Q5VZK9 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
CARMIL1Q5VZK9 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CARMIL1Q5VZK9 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CARMIL1Q5VZK9 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CARMIL1Q5VZK9 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CARMIL1Q5VZK9 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CARMIL1Q5VZK9 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CARMIL1Q5VZK9 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CARMIL1Q5VZK9 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CARMIL1Q5VZK9 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CARMIL1Q5VZK9 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CARMIL1Q5VZK9 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CARMIL1Q5VZK9 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CARMIL1Q5VZK9 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
CARMIL1Q5VZK9 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CARMIL1Q5VZK9 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CARMIL1Q5VZK9 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CARMIL1Q5VZK9 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CARMIL1Q5VZK9 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CARMIL1Q5VZK9 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CARMIL1Q5VZK9 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CARMIL1Q5VZK9 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CARMIL1Q5VZK9 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CARMIL1Q5VZK9 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CARMIL1Q5VZK9 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CARMIL1Q5VZK9 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CARMIL1Q5VZK9 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CARMIL1Q5VZK9 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
CARMIL1Q5VZK9 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CARMIL1Q5VZK9 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CARMIL1Q5VZK9 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CARMIL1Q5VZK9 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CARMIL1Q5VZK9 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CARMIL1Q5VZK9 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CARMIL1Q5VZK9 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CARMIL1Q5VZK9 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CARMIL1Q5VZK9 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CARMIL1Q5VZK9 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CARMIL1Q5VZK9 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CARMIL1Q5VZK9 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CARMIL1Q5VZK9 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
CARMIL1Q5VZK9 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CARMIL1Q5VZK9 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CARMIL1Q5VZK9 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CARMIL1Q5VZK9 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CARMIL1Q5VZK9 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CARMIL1Q5VZK9 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CARMIL1Q5VZK9 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
CARMIL1Q5VZK9 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CARMIL1Q5VZK9 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CARMIL1Q5VZK9 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
CARMIL1Q5VZK9 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CARMIL1Q5VZK9 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
CARMIL1Q5VZK9 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CARMIL1Q5VZK9 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CARMIL1Q5VZK9 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CARMIL1Q5VZK9 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CARMIL1Q5VZK9 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CARMIL1Q5VZK9 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CARMIL1Q5VZK9 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
CARMIL1Q5VZK9 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CARMIL1Q5VZK9 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CARMIL1Q5VZK9 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
CARMIL1Q5VZK9 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CARMIL1Q5VZK9 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CARMIL1Q5VZK9 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CARMIL1Q5VZK9 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
CARMIL1Q5VZK9 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CARMIL1Q5VZK9 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CARMIL1Q5VZK9 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms