Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZ18

SHE, SH2 domain-containing adapter protein E, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHEQ5VZ18 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SHEQ5VZ18 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SHEQ5VZ18 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SHEQ5VZ18 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SHEQ5VZ18 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SHEQ5VZ18 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SHEQ5VZ18 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SHEQ5VZ18 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SHEQ5VZ18 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SHEQ5VZ18 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SHEQ5VZ18 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SHEQ5VZ18 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SHEQ5VZ18 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SHEQ5VZ18 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SHEQ5VZ18 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SHEQ5VZ18 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SHEQ5VZ18 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SHEQ5VZ18 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SHEQ5VZ18 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SHEQ5VZ18 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SHEQ5VZ18 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SHEQ5VZ18 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SHEQ5VZ18 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SHEQ5VZ18 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SHEQ5VZ18 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SHEQ5VZ18 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SHEQ5VZ18 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SHEQ5VZ18 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SHEQ5VZ18 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SHEQ5VZ18 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SHEQ5VZ18 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SHEQ5VZ18 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SHEQ5VZ18 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SHEQ5VZ18 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SHEQ5VZ18 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SHEQ5VZ18 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SHEQ5VZ18 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SHEQ5VZ18 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SHEQ5VZ18 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SHEQ5VZ18 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SHEQ5VZ18 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SHEQ5VZ18 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SHEQ5VZ18 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SHEQ5VZ18 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SHEQ5VZ18 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SHEQ5VZ18 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SHEQ5VZ18 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SHEQ5VZ18 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SHEQ5VZ18 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SHEQ5VZ18 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SHEQ5VZ18 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SHEQ5VZ18 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SHEQ5VZ18 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SHEQ5VZ18 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
SHEQ5VZ18 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SHEQ5VZ18 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SHEQ5VZ18 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SHEQ5VZ18 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SHEQ5VZ18 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SHEQ5VZ18 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SHEQ5VZ18 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SHEQ5VZ18 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SHEQ5VZ18 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SHEQ5VZ18 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SHEQ5VZ18 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SHEQ5VZ18 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SHEQ5VZ18 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SHEQ5VZ18 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SHEQ5VZ18 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SHEQ5VZ18 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SHEQ5VZ18 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SHEQ5VZ18 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SHEQ5VZ18 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SHEQ5VZ18 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SHEQ5VZ18 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SHEQ5VZ18 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SHEQ5VZ18 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SHEQ5VZ18 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SHEQ5VZ18 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SHEQ5VZ18 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SHEQ5VZ18 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SHEQ5VZ18 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SHEQ5VZ18 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SHEQ5VZ18 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SHEQ5VZ18 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SHEQ5VZ18 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SHEQ5VZ18 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SHEQ5VZ18 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SHEQ5VZ18 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SHEQ5VZ18 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SHEQ5VZ18 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SHEQ5VZ18 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SHEQ5VZ18 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SHEQ5VZ18 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SHEQ5VZ18 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SHEQ5VZ18 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SHEQ5VZ18 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SHEQ5VZ18 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SHEQ5VZ18 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SHEQ5VZ18 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms