Protein–RNA interactions for Protein: Q495N2

SLC36A3, Proton-coupled amino acid transporter 3, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC36A3Q495N2 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC36A3Q495N2 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC36A3Q495N2 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC36A3Q495N2 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC36A3Q495N2 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC36A3Q495N2 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC36A3Q495N2 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC36A3Q495N2 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC36A3Q495N2 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC36A3Q495N2 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC36A3Q495N2 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC36A3Q495N2 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC36A3Q495N2 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC36A3Q495N2 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC36A3Q495N2 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC36A3Q495N2 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC36A3Q495N2 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC36A3Q495N2 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC36A3Q495N2 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC36A3Q495N2 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC36A3Q495N2 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC36A3Q495N2 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC36A3Q495N2 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC36A3Q495N2 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC36A3Q495N2 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC36A3Q495N2 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC36A3Q495N2 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC36A3Q495N2 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC36A3Q495N2 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC36A3Q495N2 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC36A3Q495N2 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC36A3Q495N2 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC36A3Q495N2 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC36A3Q495N2 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC36A3Q495N2 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC36A3Q495N2 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC36A3Q495N2 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC36A3Q495N2 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC36A3Q495N2 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC36A3Q495N2 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC36A3Q495N2 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC36A3Q495N2 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC36A3Q495N2 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC36A3Q495N2 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC36A3Q495N2 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC36A3Q495N2 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC36A3Q495N2 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC36A3Q495N2 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC36A3Q495N2 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC36A3Q495N2 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC36A3Q495N2 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC36A3Q495N2 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC36A3Q495N2 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC36A3Q495N2 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC36A3Q495N2 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC36A3Q495N2 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC36A3Q495N2 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC36A3Q495N2 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC36A3Q495N2 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC36A3Q495N2 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC36A3Q495N2 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC36A3Q495N2 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SLC36A3Q495N2 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SLC36A3Q495N2 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SLC36A3Q495N2 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SLC36A3Q495N2 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SLC36A3Q495N2 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SLC36A3Q495N2 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SLC36A3Q495N2 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SLC36A3Q495N2 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SLC36A3Q495N2 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SLC36A3Q495N2 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SLC36A3Q495N2 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SLC36A3Q495N2 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SLC36A3Q495N2 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC36A3Q495N2 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC36A3Q495N2 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC36A3Q495N2 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC36A3Q495N2 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC36A3Q495N2 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC36A3Q495N2 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC36A3Q495N2 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC36A3Q495N2 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC36A3Q495N2 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC36A3Q495N2 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC36A3Q495N2 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC36A3Q495N2 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC36A3Q495N2 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC36A3Q495N2 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC36A3Q495N2 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC36A3Q495N2 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC36A3Q495N2 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC36A3Q495N2 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC36A3Q495N2 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC36A3Q495N2 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC36A3Q495N2 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC36A3Q495N2 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC36A3Q495N2 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC36A3Q495N2 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC36A3Q495N2 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms