Protein–RNA interactions for Protein: Q32P28

P3H1, Prolyl 3-hydroxylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P3H1Q32P28 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
P3H1Q32P28 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
P3H1Q32P28 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
P3H1Q32P28 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
P3H1Q32P28 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
P3H1Q32P28 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
P3H1Q32P28 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
P3H1Q32P28 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
P3H1Q32P28 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
P3H1Q32P28 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
P3H1Q32P28 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
P3H1Q32P28 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
P3H1Q32P28 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
P3H1Q32P28 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
P3H1Q32P28 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
P3H1Q32P28 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
P3H1Q32P28 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
P3H1Q32P28 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
P3H1Q32P28 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
P3H1Q32P28 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
P3H1Q32P28 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
P3H1Q32P28 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
P3H1Q32P28 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
P3H1Q32P28 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
P3H1Q32P28 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
P3H1Q32P28 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
P3H1Q32P28 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
P3H1Q32P28 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
P3H1Q32P28 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
P3H1Q32P28 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
P3H1Q32P28 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
P3H1Q32P28 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
P3H1Q32P28 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
P3H1Q32P28 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
P3H1Q32P28 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
P3H1Q32P28 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
P3H1Q32P28 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
P3H1Q32P28 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
P3H1Q32P28 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
P3H1Q32P28 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
P3H1Q32P28 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
P3H1Q32P28 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
P3H1Q32P28 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
P3H1Q32P28 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
P3H1Q32P28 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
P3H1Q32P28 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
P3H1Q32P28 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
P3H1Q32P28 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
P3H1Q32P28 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
P3H1Q32P28 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
P3H1Q32P28 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
P3H1Q32P28 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
P3H1Q32P28 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
P3H1Q32P28 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
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P3H1Q32P28 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
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P3H1Q32P28 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
P3H1Q32P28 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
P3H1Q32P28 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
P3H1Q32P28 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
P3H1Q32P28 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
P3H1Q32P28 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
P3H1Q32P28 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
P3H1Q32P28 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
P3H1Q32P28 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
P3H1Q32P28 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
P3H1Q32P28 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
P3H1Q32P28 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
P3H1Q32P28 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
P3H1Q32P28 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
P3H1Q32P28 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
P3H1Q32P28 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
P3H1Q32P28 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
P3H1Q32P28 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
P3H1Q32P28 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
P3H1Q32P28 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
P3H1Q32P28 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
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P3H1Q32P28 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
P3H1Q32P28 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
P3H1Q32P28 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
P3H1Q32P28 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
P3H1Q32P28 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
P3H1Q32P28 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
P3H1Q32P28 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
P3H1Q32P28 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
P3H1Q32P28 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
P3H1Q32P28 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
P3H1Q32P28 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
P3H1Q32P28 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
P3H1Q32P28 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
P3H1Q32P28 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
P3H1Q32P28 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
P3H1Q32P28 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
P3H1Q32P28 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
P3H1Q32P28 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
P3H1Q32P28 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
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