Protein–RNA interactions for Protein: Q2M2E3

ODF4, Outer dense fiber protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF4Q2M2E3 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ODF4Q2M2E3 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
ODF4Q2M2E3 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ODF4Q2M2E3 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
ODF4Q2M2E3 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ODF4Q2M2E3 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ODF4Q2M2E3 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ODF4Q2M2E3 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ODF4Q2M2E3 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ODF4Q2M2E3 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ODF4Q2M2E3 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ODF4Q2M2E3 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ODF4Q2M2E3 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ODF4Q2M2E3 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ODF4Q2M2E3 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ODF4Q2M2E3 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ODF4Q2M2E3 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ODF4Q2M2E3 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ODF4Q2M2E3 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ODF4Q2M2E3 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ODF4Q2M2E3 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ODF4Q2M2E3 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ODF4Q2M2E3 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ODF4Q2M2E3 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ODF4Q2M2E3 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ODF4Q2M2E3 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ODF4Q2M2E3 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ODF4Q2M2E3 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ODF4Q2M2E3 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
ODF4Q2M2E3 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ODF4Q2M2E3 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ODF4Q2M2E3 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ODF4Q2M2E3 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
ODF4Q2M2E3 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ODF4Q2M2E3 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ODF4Q2M2E3 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ODF4Q2M2E3 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ODF4Q2M2E3 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ODF4Q2M2E3 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ODF4Q2M2E3 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ODF4Q2M2E3 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ODF4Q2M2E3 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ODF4Q2M2E3 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ODF4Q2M2E3 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ODF4Q2M2E3 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ODF4Q2M2E3 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ODF4Q2M2E3 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ODF4Q2M2E3 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ODF4Q2M2E3 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ODF4Q2M2E3 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ODF4Q2M2E3 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ODF4Q2M2E3 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ODF4Q2M2E3 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ODF4Q2M2E3 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ODF4Q2M2E3 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ODF4Q2M2E3 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ODF4Q2M2E3 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ODF4Q2M2E3 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ODF4Q2M2E3 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ODF4Q2M2E3 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ODF4Q2M2E3 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ODF4Q2M2E3 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ODF4Q2M2E3 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ODF4Q2M2E3 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ODF4Q2M2E3 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ODF4Q2M2E3 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ODF4Q2M2E3 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ODF4Q2M2E3 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ODF4Q2M2E3 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ODF4Q2M2E3 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ODF4Q2M2E3 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ODF4Q2M2E3 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ODF4Q2M2E3 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ODF4Q2M2E3 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ODF4Q2M2E3 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ODF4Q2M2E3 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ODF4Q2M2E3 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ODF4Q2M2E3 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ODF4Q2M2E3 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ODF4Q2M2E3 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ODF4Q2M2E3 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ODF4Q2M2E3 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ODF4Q2M2E3 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ODF4Q2M2E3 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ODF4Q2M2E3 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ODF4Q2M2E3 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ODF4Q2M2E3 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ODF4Q2M2E3 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ODF4Q2M2E3 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ODF4Q2M2E3 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ODF4Q2M2E3 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ODF4Q2M2E3 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ODF4Q2M2E3 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ODF4Q2M2E3 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ODF4Q2M2E3 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ODF4Q2M2E3 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ODF4Q2M2E3 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ODF4Q2M2E3 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ODF4Q2M2E3 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ODF4Q2M2E3 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms