Protein–RNA interactions for Protein: Q2KHR2

RFX7, DNA-binding protein RFX7, humanhuman

Predictions only

Length 1,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX7Q2KHR2 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RFX7Q2KHR2 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RFX7Q2KHR2 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RFX7Q2KHR2 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RFX7Q2KHR2 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RFX7Q2KHR2 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
RFX7Q2KHR2 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RFX7Q2KHR2 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RFX7Q2KHR2 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RFX7Q2KHR2 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RFX7Q2KHR2 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RFX7Q2KHR2 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
RFX7Q2KHR2 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
RFX7Q2KHR2 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RFX7Q2KHR2 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RFX7Q2KHR2 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RFX7Q2KHR2 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
RFX7Q2KHR2 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RFX7Q2KHR2 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RFX7Q2KHR2 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RFX7Q2KHR2 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RFX7Q2KHR2 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
RFX7Q2KHR2 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RFX7Q2KHR2 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
RFX7Q2KHR2 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RFX7Q2KHR2 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RFX7Q2KHR2 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RFX7Q2KHR2 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RFX7Q2KHR2 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RFX7Q2KHR2 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RFX7Q2KHR2 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RFX7Q2KHR2 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RFX7Q2KHR2 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RFX7Q2KHR2 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RFX7Q2KHR2 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RFX7Q2KHR2 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RFX7Q2KHR2 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RFX7Q2KHR2 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RFX7Q2KHR2 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
RFX7Q2KHR2 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RFX7Q2KHR2 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RFX7Q2KHR2 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RFX7Q2KHR2 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RFX7Q2KHR2 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RFX7Q2KHR2 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RFX7Q2KHR2 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RFX7Q2KHR2 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RFX7Q2KHR2 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RFX7Q2KHR2 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RFX7Q2KHR2 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RFX7Q2KHR2 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RFX7Q2KHR2 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RFX7Q2KHR2 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RFX7Q2KHR2 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RFX7Q2KHR2 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RFX7Q2KHR2 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RFX7Q2KHR2 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RFX7Q2KHR2 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RFX7Q2KHR2 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RFX7Q2KHR2 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RFX7Q2KHR2 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RFX7Q2KHR2 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RFX7Q2KHR2 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RFX7Q2KHR2 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RFX7Q2KHR2 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RFX7Q2KHR2 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RFX7Q2KHR2 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RFX7Q2KHR2 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RFX7Q2KHR2 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RFX7Q2KHR2 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RFX7Q2KHR2 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RFX7Q2KHR2 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RFX7Q2KHR2 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RFX7Q2KHR2 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RFX7Q2KHR2 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RFX7Q2KHR2 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RFX7Q2KHR2 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RFX7Q2KHR2 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RFX7Q2KHR2 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RFX7Q2KHR2 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RFX7Q2KHR2 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RFX7Q2KHR2 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RFX7Q2KHR2 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RFX7Q2KHR2 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RFX7Q2KHR2 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RFX7Q2KHR2 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RFX7Q2KHR2 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RFX7Q2KHR2 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RFX7Q2KHR2 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RFX7Q2KHR2 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RFX7Q2KHR2 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RFX7Q2KHR2 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RFX7Q2KHR2 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RFX7Q2KHR2 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RFX7Q2KHR2 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RFX7Q2KHR2 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RFX7Q2KHR2 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RFX7Q2KHR2 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RFX7Q2KHR2 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RFX7Q2KHR2 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms