Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RTN1Q16799 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RTN1Q16799 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RTN1Q16799 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RTN1Q16799 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RTN1Q16799 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RTN1Q16799 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RTN1Q16799 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RTN1Q16799 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RTN1Q16799 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RTN1Q16799 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RTN1Q16799 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
RTN1Q16799 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RTN1Q16799 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RTN1Q16799 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RTN1Q16799 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RTN1Q16799 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RTN1Q16799 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RTN1Q16799 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RTN1Q16799 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RTN1Q16799 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
RTN1Q16799 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RTN1Q16799 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RTN1Q16799 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RTN1Q16799 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RTN1Q16799 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RTN1Q16799 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RTN1Q16799 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RTN1Q16799 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RTN1Q16799 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RTN1Q16799 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RTN1Q16799 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RTN1Q16799 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RTN1Q16799 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RTN1Q16799 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RTN1Q16799 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RTN1Q16799 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RTN1Q16799 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RTN1Q16799 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RTN1Q16799 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RTN1Q16799 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RTN1Q16799 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RTN1Q16799 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RTN1Q16799 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RTN1Q16799 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RTN1Q16799 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
RTN1Q16799 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RTN1Q16799 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RTN1Q16799 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
RTN1Q16799 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RTN1Q16799 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
RTN1Q16799 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RTN1Q16799 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RTN1Q16799 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
RTN1Q16799 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RTN1Q16799 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
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RTN1Q16799 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RTN1Q16799 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
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RTN1Q16799 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RTN1Q16799 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RTN1Q16799 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
RTN1Q16799 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RTN1Q16799 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
RTN1Q16799 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
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RTN1Q16799 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RTN1Q16799 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RTN1Q16799 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RTN1Q16799 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RTN1Q16799 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
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RTN1Q16799 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
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RTN1Q16799 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
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RTN1Q16799 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
RTN1Q16799 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RTN1Q16799 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RTN1Q16799 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RTN1Q16799 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RTN1Q16799 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RTN1Q16799 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RTN1Q16799 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RTN1Q16799 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RTN1Q16799 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RTN1Q16799 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RTN1Q16799 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RTN1Q16799 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RTN1Q16799 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RTN1Q16799 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RTN1Q16799 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RTN1Q16799 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RTN1Q16799 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC21.31■■□□□ 1
RTN1Q16799 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RTN1Q16799 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
RTN1Q16799 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
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