Protein–RNA interactions for Protein: Q16795

NDUFA9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 9, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA9Q16795 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NDUFA9Q16795 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NDUFA9Q16795 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NDUFA9Q16795 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NDUFA9Q16795 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NDUFA9Q16795 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NDUFA9Q16795 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NDUFA9Q16795 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NDUFA9Q16795 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NDUFA9Q16795 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NDUFA9Q16795 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NDUFA9Q16795 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NDUFA9Q16795 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
NDUFA9Q16795 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
NDUFA9Q16795 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NDUFA9Q16795 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NDUFA9Q16795 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NDUFA9Q16795 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NDUFA9Q16795 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
NDUFA9Q16795 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NDUFA9Q16795 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
NDUFA9Q16795 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NDUFA9Q16795 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NDUFA9Q16795 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NDUFA9Q16795 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NDUFA9Q16795 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NDUFA9Q16795 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NDUFA9Q16795 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NDUFA9Q16795 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NDUFA9Q16795 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NDUFA9Q16795 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NDUFA9Q16795 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NDUFA9Q16795 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NDUFA9Q16795 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NDUFA9Q16795 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NDUFA9Q16795 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NDUFA9Q16795 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NDUFA9Q16795 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NDUFA9Q16795 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NDUFA9Q16795 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
NDUFA9Q16795 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NDUFA9Q16795 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NDUFA9Q16795 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NDUFA9Q16795 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NDUFA9Q16795 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NDUFA9Q16795 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NDUFA9Q16795 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
NDUFA9Q16795 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NDUFA9Q16795 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NDUFA9Q16795 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NDUFA9Q16795 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
NDUFA9Q16795 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NDUFA9Q16795 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
NDUFA9Q16795 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NDUFA9Q16795 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NDUFA9Q16795 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
NDUFA9Q16795 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
NDUFA9Q16795 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NDUFA9Q16795 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NDUFA9Q16795 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NDUFA9Q16795 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NDUFA9Q16795 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NDUFA9Q16795 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NDUFA9Q16795 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NDUFA9Q16795 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NDUFA9Q16795 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NDUFA9Q16795 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NDUFA9Q16795 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NDUFA9Q16795 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
NDUFA9Q16795 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NDUFA9Q16795 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NDUFA9Q16795 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NDUFA9Q16795 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
NDUFA9Q16795 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
NDUFA9Q16795 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NDUFA9Q16795 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NDUFA9Q16795 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NDUFA9Q16795 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
NDUFA9Q16795 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NDUFA9Q16795 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NDUFA9Q16795 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NDUFA9Q16795 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NDUFA9Q16795 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NDUFA9Q16795 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NDUFA9Q16795 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NDUFA9Q16795 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NDUFA9Q16795 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NDUFA9Q16795 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NDUFA9Q16795 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NDUFA9Q16795 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NDUFA9Q16795 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NDUFA9Q16795 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NDUFA9Q16795 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NDUFA9Q16795 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NDUFA9Q16795 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NDUFA9Q16795 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NDUFA9Q16795 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NDUFA9Q16795 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NDUFA9Q16795 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NDUFA9Q16795 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms