Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CLPPQ16740 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CLPPQ16740 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CLPPQ16740 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CLPPQ16740 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CLPPQ16740 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CLPPQ16740 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CLPPQ16740 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CLPPQ16740 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CLPPQ16740 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CLPPQ16740 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CLPPQ16740 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CLPPQ16740 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CLPPQ16740 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CLPPQ16740 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CLPPQ16740 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CLPPQ16740 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CLPPQ16740 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CLPPQ16740 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CLPPQ16740 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CLPPQ16740 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CLPPQ16740 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CLPPQ16740 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CLPPQ16740 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CLPPQ16740 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CLPPQ16740 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CLPPQ16740 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CLPPQ16740 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CLPPQ16740 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CLPPQ16740 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CLPPQ16740 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CLPPQ16740 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CLPPQ16740 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CLPPQ16740 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CLPPQ16740 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CLPPQ16740 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CLPPQ16740 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CLPPQ16740 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CLPPQ16740 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CLPPQ16740 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CLPPQ16740 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
CLPPQ16740 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
CLPPQ16740 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
CLPPQ16740 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CLPPQ16740 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CLPPQ16740 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CLPPQ16740 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CLPPQ16740 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CLPPQ16740 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CLPPQ16740 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CLPPQ16740 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CLPPQ16740 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CLPPQ16740 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CLPPQ16740 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CLPPQ16740 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CLPPQ16740 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CLPPQ16740 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CLPPQ16740 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CLPPQ16740 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CLPPQ16740 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CLPPQ16740 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CLPPQ16740 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CLPPQ16740 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CLPPQ16740 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CLPPQ16740 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CLPPQ16740 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CLPPQ16740 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CLPPQ16740 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CLPPQ16740 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CLPPQ16740 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CLPPQ16740 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CLPPQ16740 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CLPPQ16740 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CLPPQ16740 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CLPPQ16740 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CLPPQ16740 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CLPPQ16740 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CLPPQ16740 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CLPPQ16740 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CLPPQ16740 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CLPPQ16740 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CLPPQ16740 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CLPPQ16740 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CLPPQ16740 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CLPPQ16740 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CLPPQ16740 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CLPPQ16740 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CLPPQ16740 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CLPPQ16740 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CLPPQ16740 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CLPPQ16740 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CLPPQ16740 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CLPPQ16740 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CLPPQ16740 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CLPPQ16740 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CLPPQ16740 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CLPPQ16740 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CLPPQ16740 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CLPPQ16740 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CLPPQ16740 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
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