Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

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Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SGCAQ16586 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SGCAQ16586 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SGCAQ16586 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SGCAQ16586 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SGCAQ16586 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SGCAQ16586 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SGCAQ16586 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SGCAQ16586 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SGCAQ16586 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SGCAQ16586 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SGCAQ16586 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SGCAQ16586 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SGCAQ16586 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SGCAQ16586 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SGCAQ16586 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SGCAQ16586 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SGCAQ16586 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SGCAQ16586 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SGCAQ16586 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SGCAQ16586 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SGCAQ16586 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SGCAQ16586 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SGCAQ16586 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SGCAQ16586 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SGCAQ16586 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SGCAQ16586 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SGCAQ16586 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SGCAQ16586 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SGCAQ16586 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SGCAQ16586 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SGCAQ16586 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SGCAQ16586 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SGCAQ16586 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SGCAQ16586 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SGCAQ16586 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SGCAQ16586 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SGCAQ16586 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SGCAQ16586 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SGCAQ16586 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SGCAQ16586 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SGCAQ16586 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SGCAQ16586 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
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SGCAQ16586 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SGCAQ16586 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SGCAQ16586 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SGCAQ16586 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SGCAQ16586 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SGCAQ16586 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SGCAQ16586 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SGCAQ16586 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SGCAQ16586 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
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SGCAQ16586 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SGCAQ16586 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SGCAQ16586 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SGCAQ16586 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
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SGCAQ16586 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SGCAQ16586 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SGCAQ16586 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SGCAQ16586 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SGCAQ16586 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SGCAQ16586 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SGCAQ16586 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SGCAQ16586 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
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SGCAQ16586 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SGCAQ16586 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SGCAQ16586 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SGCAQ16586 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
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SGCAQ16586 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SGCAQ16586 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SGCAQ16586 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SGCAQ16586 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SGCAQ16586 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SGCAQ16586 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
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SGCAQ16586 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SGCAQ16586 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SGCAQ16586 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SGCAQ16586 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SGCAQ16586 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SGCAQ16586 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SGCAQ16586 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SGCAQ16586 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SGCAQ16586 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SGCAQ16586 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SGCAQ16586 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SGCAQ16586 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SGCAQ16586 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SGCAQ16586 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SGCAQ16586 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
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