Protein–RNA interactions for Protein: Q16526

CRY1, Cryptochrome-1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRY1Q16526 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CRY1Q16526 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
CRY1Q16526 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CRY1Q16526 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CRY1Q16526 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CRY1Q16526 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CRY1Q16526 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CRY1Q16526 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CRY1Q16526 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CRY1Q16526 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CRY1Q16526 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CRY1Q16526 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CRY1Q16526 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CRY1Q16526 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CRY1Q16526 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CRY1Q16526 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CRY1Q16526 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CRY1Q16526 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CRY1Q16526 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CRY1Q16526 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CRY1Q16526 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CRY1Q16526 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CRY1Q16526 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CRY1Q16526 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
CRY1Q16526 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CRY1Q16526 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CRY1Q16526 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CRY1Q16526 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CRY1Q16526 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CRY1Q16526 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
CRY1Q16526 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
CRY1Q16526 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CRY1Q16526 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CRY1Q16526 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CRY1Q16526 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CRY1Q16526 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CRY1Q16526 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CRY1Q16526 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CRY1Q16526 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CRY1Q16526 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CRY1Q16526 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CRY1Q16526 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CRY1Q16526 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CRY1Q16526 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CRY1Q16526 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CRY1Q16526 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CRY1Q16526 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CRY1Q16526 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CRY1Q16526 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CRY1Q16526 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CRY1Q16526 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CRY1Q16526 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CRY1Q16526 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CRY1Q16526 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CRY1Q16526 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CRY1Q16526 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CRY1Q16526 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CRY1Q16526 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CRY1Q16526 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CRY1Q16526 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CRY1Q16526 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CRY1Q16526 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CRY1Q16526 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CRY1Q16526 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CRY1Q16526 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CRY1Q16526 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CRY1Q16526 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CRY1Q16526 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CRY1Q16526 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CRY1Q16526 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CRY1Q16526 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CRY1Q16526 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CRY1Q16526 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CRY1Q16526 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CRY1Q16526 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CRY1Q16526 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CRY1Q16526 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CRY1Q16526 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CRY1Q16526 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CRY1Q16526 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CRY1Q16526 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CRY1Q16526 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CRY1Q16526 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CRY1Q16526 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CRY1Q16526 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CRY1Q16526 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CRY1Q16526 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CRY1Q16526 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CRY1Q16526 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CRY1Q16526 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CRY1Q16526 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CRY1Q16526 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CRY1Q16526 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CRY1Q16526 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CRY1Q16526 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CRY1Q16526 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CRY1Q16526 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CRY1Q16526 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CRY1Q16526 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CRY1Q16526 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms