Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RPE65Q16518 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RPE65Q16518 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RPE65Q16518 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RPE65Q16518 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RPE65Q16518 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RPE65Q16518 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RPE65Q16518 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RPE65Q16518 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RPE65Q16518 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RPE65Q16518 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RPE65Q16518 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RPE65Q16518 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RPE65Q16518 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RPE65Q16518 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
RPE65Q16518 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RPE65Q16518 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
RPE65Q16518 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RPE65Q16518 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
RPE65Q16518 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RPE65Q16518 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
RPE65Q16518 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPE65Q16518 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPE65Q16518 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPE65Q16518 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPE65Q16518 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPE65Q16518 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPE65Q16518 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPE65Q16518 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPE65Q16518 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPE65Q16518 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPE65Q16518 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
RPE65Q16518 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
RPE65Q16518 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPE65Q16518 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPE65Q16518 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPE65Q16518 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPE65Q16518 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPE65Q16518 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
RPE65Q16518 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPE65Q16518 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPE65Q16518 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPE65Q16518 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPE65Q16518 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPE65Q16518 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPE65Q16518 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPE65Q16518 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPE65Q16518 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPE65Q16518 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPE65Q16518 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPE65Q16518 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPE65Q16518 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RPE65Q16518 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RPE65Q16518 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RPE65Q16518 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RPE65Q16518 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RPE65Q16518 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
RPE65Q16518 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RPE65Q16518 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RPE65Q16518 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RPE65Q16518 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RPE65Q16518 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RPE65Q16518 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RPE65Q16518 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RPE65Q16518 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RPE65Q16518 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RPE65Q16518 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RPE65Q16518 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RPE65Q16518 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RPE65Q16518 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RPE65Q16518 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RPE65Q16518 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RPE65Q16518 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RPE65Q16518 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
RPE65Q16518 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
RPE65Q16518 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RPE65Q16518 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RPE65Q16518 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RPE65Q16518 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RPE65Q16518 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
RPE65Q16518 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RPE65Q16518 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RPE65Q16518 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RPE65Q16518 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RPE65Q16518 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
RPE65Q16518 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RPE65Q16518 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RPE65Q16518 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RPE65Q16518 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RPE65Q16518 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RPE65Q16518 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RPE65Q16518 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RPE65Q16518 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RPE65Q16518 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RPE65Q16518 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RPE65Q16518 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RPE65Q16518 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RPE65Q16518 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RPE65Q16518 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RPE65Q16518 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
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