Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
USF2Q15853 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
USF2Q15853 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
USF2Q15853 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
USF2Q15853 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
USF2Q15853 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
USF2Q15853 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
USF2Q15853 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
USF2Q15853 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
USF2Q15853 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
USF2Q15853 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
USF2Q15853 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
USF2Q15853 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
USF2Q15853 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
USF2Q15853 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
USF2Q15853 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
USF2Q15853 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
USF2Q15853 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
USF2Q15853 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
USF2Q15853 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
USF2Q15853 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
USF2Q15853 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
USF2Q15853 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
USF2Q15853 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
USF2Q15853 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
USF2Q15853 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
USF2Q15853 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
USF2Q15853 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
USF2Q15853 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
USF2Q15853 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
USF2Q15853 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
USF2Q15853 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
USF2Q15853 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
USF2Q15853 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
USF2Q15853 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
USF2Q15853 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
USF2Q15853 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
USF2Q15853 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
USF2Q15853 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
USF2Q15853 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
USF2Q15853 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
USF2Q15853 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
USF2Q15853 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
USF2Q15853 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
USF2Q15853 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
USF2Q15853 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
USF2Q15853 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
USF2Q15853 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
USF2Q15853 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
USF2Q15853 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
USF2Q15853 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
USF2Q15853 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
USF2Q15853 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
USF2Q15853 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
USF2Q15853 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
USF2Q15853 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
USF2Q15853 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
USF2Q15853 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
USF2Q15853 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
USF2Q15853 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
USF2Q15853 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
USF2Q15853 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
USF2Q15853 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
USF2Q15853 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
USF2Q15853 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
USF2Q15853 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
USF2Q15853 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
USF2Q15853 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
USF2Q15853 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
USF2Q15853 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
USF2Q15853 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
USF2Q15853 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
USF2Q15853 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
USF2Q15853 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
USF2Q15853 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
USF2Q15853 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
USF2Q15853 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
USF2Q15853 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
USF2Q15853 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
USF2Q15853 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
USF2Q15853 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
USF2Q15853 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
USF2Q15853 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
USF2Q15853 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
USF2Q15853 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
USF2Q15853 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
USF2Q15853 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
USF2Q15853 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
USF2Q15853 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
USF2Q15853 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
USF2Q15853 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
USF2Q15853 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
USF2Q15853 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
USF2Q15853 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
USF2Q15853 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
USF2Q15853 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
USF2Q15853 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
USF2Q15853 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
USF2Q15853 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
USF2Q15853 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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