Protein–RNA interactions for Protein: Q15413

RYR3, Ryanodine receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,870 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYR3Q15413 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
RYR3Q15413 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
RYR3Q15413 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
RYR3Q15413 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
RYR3Q15413 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
RYR3Q15413 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
RYR3Q15413 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
RYR3Q15413 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
RYR3Q15413 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
RYR3Q15413 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
RYR3Q15413 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
RYR3Q15413 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
RYR3Q15413 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
RYR3Q15413 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
RYR3Q15413 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
RYR3Q15413 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
RYR3Q15413 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
RYR3Q15413 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
RYR3Q15413 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
RYR3Q15413 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
RYR3Q15413 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
RYR3Q15413 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
RYR3Q15413 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
RYR3Q15413 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
RYR3Q15413 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
RYR3Q15413 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
RYR3Q15413 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
RYR3Q15413 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
RYR3Q15413 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
RYR3Q15413 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
RYR3Q15413 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.46
RYR3Q15413 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.46
RYR3Q15413 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
RYR3Q15413 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
RYR3Q15413 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
RYR3Q15413 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
RYR3Q15413 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
RYR3Q15413 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
RYR3Q15413 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
RYR3Q15413 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
RYR3Q15413 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
RYR3Q15413 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
RYR3Q15413 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
RYR3Q15413 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
RYR3Q15413 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
RYR3Q15413 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
RYR3Q15413 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
RYR3Q15413 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
RYR3Q15413 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
RYR3Q15413 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
RYR3Q15413 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
RYR3Q15413 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
RYR3Q15413 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
RYR3Q15413 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
RYR3Q15413 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
RYR3Q15413 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
RYR3Q15413 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
RYR3Q15413 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
RYR3Q15413 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
RYR3Q15413 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
RYR3Q15413 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
RYR3Q15413 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
RYR3Q15413 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
RYR3Q15413 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
RYR3Q15413 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
RYR3Q15413 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
RYR3Q15413 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
RYR3Q15413 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
RYR3Q15413 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
RYR3Q15413 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
RYR3Q15413 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
RYR3Q15413 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
RYR3Q15413 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
RYR3Q15413 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
RYR3Q15413 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
RYR3Q15413 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
RYR3Q15413 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
RYR3Q15413 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
RYR3Q15413 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
RYR3Q15413 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
RYR3Q15413 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
RYR3Q15413 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
RYR3Q15413 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
RYR3Q15413 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
RYR3Q15413 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
RYR3Q15413 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
RYR3Q15413 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
RYR3Q15413 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
RYR3Q15413 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
RYR3Q15413 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
RYR3Q15413 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
RYR3Q15413 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
RYR3Q15413 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
RYR3Q15413 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
RYR3Q15413 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
RYR3Q15413 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
RYR3Q15413 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
RYR3Q15413 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
RYR3Q15413 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
RYR3Q15413 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
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