Protein–RNA interactions for Protein: Q15286

RAB35, Ras-related protein Rab-35, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB35Q15286 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB35Q15286 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB35Q15286 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB35Q15286 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB35Q15286 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB35Q15286 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB35Q15286 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB35Q15286 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB35Q15286 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB35Q15286 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB35Q15286 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB35Q15286 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB35Q15286 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB35Q15286 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB35Q15286 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB35Q15286 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB35Q15286 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB35Q15286 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB35Q15286 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB35Q15286 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB35Q15286 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB35Q15286 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB35Q15286 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB35Q15286 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB35Q15286 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB35Q15286 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB35Q15286 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB35Q15286 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB35Q15286 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB35Q15286 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB35Q15286 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB35Q15286 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB35Q15286 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB35Q15286 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB35Q15286 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB35Q15286 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB35Q15286 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB35Q15286 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB35Q15286 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB35Q15286 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB35Q15286 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB35Q15286 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB35Q15286 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB35Q15286 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB35Q15286 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB35Q15286 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB35Q15286 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB35Q15286 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB35Q15286 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB35Q15286 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB35Q15286 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB35Q15286 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB35Q15286 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB35Q15286 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB35Q15286 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB35Q15286 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB35Q15286 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB35Q15286 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB35Q15286 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB35Q15286 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB35Q15286 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB35Q15286 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB35Q15286 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB35Q15286 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB35Q15286 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB35Q15286 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
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RAB35Q15286 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB35Q15286 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
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RAB35Q15286 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB35Q15286 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB35Q15286 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB35Q15286 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB35Q15286 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB35Q15286 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB35Q15286 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB35Q15286 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB35Q15286 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB35Q15286 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB35Q15286 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB35Q15286 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB35Q15286 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB35Q15286 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB35Q15286 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB35Q15286 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB35Q15286 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB35Q15286 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB35Q15286 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB35Q15286 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB35Q15286 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB35Q15286 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB35Q15286 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB35Q15286 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB35Q15286 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
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