Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PDCD1Q15116 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PDCD1Q15116 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PDCD1Q15116 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PDCD1Q15116 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PDCD1Q15116 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PDCD1Q15116 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PDCD1Q15116 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PDCD1Q15116 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PDCD1Q15116 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PDCD1Q15116 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PDCD1Q15116 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PDCD1Q15116 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PDCD1Q15116 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PDCD1Q15116 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PDCD1Q15116 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PDCD1Q15116 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PDCD1Q15116 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PDCD1Q15116 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PDCD1Q15116 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PDCD1Q15116 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PDCD1Q15116 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PDCD1Q15116 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PDCD1Q15116 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PDCD1Q15116 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PDCD1Q15116 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PDCD1Q15116 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PDCD1Q15116 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PDCD1Q15116 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PDCD1Q15116 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PDCD1Q15116 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PDCD1Q15116 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PDCD1Q15116 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PDCD1Q15116 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PDCD1Q15116 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PDCD1Q15116 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PDCD1Q15116 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PDCD1Q15116 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PDCD1Q15116 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PDCD1Q15116 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PDCD1Q15116 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PDCD1Q15116 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PDCD1Q15116 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PDCD1Q15116 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PDCD1Q15116 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PDCD1Q15116 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PDCD1Q15116 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PDCD1Q15116 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PDCD1Q15116 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PDCD1Q15116 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PDCD1Q15116 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PDCD1Q15116 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PDCD1Q15116 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PDCD1Q15116 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PDCD1Q15116 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PDCD1Q15116 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PDCD1Q15116 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PDCD1Q15116 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PDCD1Q15116 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PDCD1Q15116 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PDCD1Q15116 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PDCD1Q15116 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PDCD1Q15116 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PDCD1Q15116 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PDCD1Q15116 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PDCD1Q15116 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PDCD1Q15116 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PDCD1Q15116 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PDCD1Q15116 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PDCD1Q15116 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PDCD1Q15116 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PDCD1Q15116 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PDCD1Q15116 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PDCD1Q15116 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PDCD1Q15116 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PDCD1Q15116 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PDCD1Q15116 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PDCD1Q15116 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PDCD1Q15116 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PDCD1Q15116 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PDCD1Q15116 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PDCD1Q15116 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PDCD1Q15116 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PDCD1Q15116 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PDCD1Q15116 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PDCD1Q15116 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PDCD1Q15116 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PDCD1Q15116 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PDCD1Q15116 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PDCD1Q15116 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PDCD1Q15116 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PDCD1Q15116 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PDCD1Q15116 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PDCD1Q15116 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PDCD1Q15116 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PDCD1Q15116 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PDCD1Q15116 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PDCD1Q15116 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PDCD1Q15116 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PDCD1Q15116 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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