Protein–RNA interactions for Protein: Q15113

PCOLCE, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCEQ15113 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PCOLCEQ15113 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PCOLCEQ15113 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PCOLCEQ15113 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PCOLCEQ15113 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PCOLCEQ15113 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PCOLCEQ15113 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PCOLCEQ15113 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PCOLCEQ15113 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PCOLCEQ15113 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PCOLCEQ15113 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PCOLCEQ15113 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PCOLCEQ15113 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
PCOLCEQ15113 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PCOLCEQ15113 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PCOLCEQ15113 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PCOLCEQ15113 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
PCOLCEQ15113 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PCOLCEQ15113 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PCOLCEQ15113 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PCOLCEQ15113 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PCOLCEQ15113 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PCOLCEQ15113 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PCOLCEQ15113 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PCOLCEQ15113 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PCOLCEQ15113 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PCOLCEQ15113 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PCOLCEQ15113 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PCOLCEQ15113 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PCOLCEQ15113 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PCOLCEQ15113 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
PCOLCEQ15113 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
PCOLCEQ15113 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PCOLCEQ15113 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PCOLCEQ15113 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PCOLCEQ15113 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PCOLCEQ15113 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PCOLCEQ15113 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PCOLCEQ15113 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PCOLCEQ15113 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PCOLCEQ15113 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PCOLCEQ15113 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PCOLCEQ15113 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
PCOLCEQ15113 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
PCOLCEQ15113 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
PCOLCEQ15113 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PCOLCEQ15113 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PCOLCEQ15113 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PCOLCEQ15113 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PCOLCEQ15113 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PCOLCEQ15113 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PCOLCEQ15113 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PCOLCEQ15113 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PCOLCEQ15113 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PCOLCEQ15113 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
PCOLCEQ15113 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PCOLCEQ15113 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PCOLCEQ15113 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PCOLCEQ15113 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PCOLCEQ15113 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PCOLCEQ15113 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PCOLCEQ15113 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PCOLCEQ15113 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PCOLCEQ15113 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PCOLCEQ15113 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PCOLCEQ15113 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PCOLCEQ15113 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PCOLCEQ15113 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PCOLCEQ15113 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PCOLCEQ15113 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PCOLCEQ15113 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PCOLCEQ15113 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PCOLCEQ15113 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PCOLCEQ15113 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PCOLCEQ15113 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PCOLCEQ15113 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PCOLCEQ15113 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PCOLCEQ15113 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PCOLCEQ15113 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
PCOLCEQ15113 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PCOLCEQ15113 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PCOLCEQ15113 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
PCOLCEQ15113 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
PCOLCEQ15113 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PCOLCEQ15113 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PCOLCEQ15113 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PCOLCEQ15113 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PCOLCEQ15113 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PCOLCEQ15113 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PCOLCEQ15113 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PCOLCEQ15113 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PCOLCEQ15113 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PCOLCEQ15113 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PCOLCEQ15113 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
PCOLCEQ15113 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PCOLCEQ15113 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PCOLCEQ15113 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PCOLCEQ15113 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PCOLCEQ15113 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PCOLCEQ15113 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms